More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3014 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3014  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  393  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.37376 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  41.46 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  41.82 
 
 		 191 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0139  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 183 aa  121  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2779  MerR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 185 aa  121  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 188 aa  120  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 173 aa  118  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2794  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  45.65 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  43.33 
 
 		 259 aa  71.6  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  44.44 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  45.71 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 390 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  32.79 
 
 		 139 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  32.79 
 
 		 139 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  48.48 
 
 		 253 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  39.33 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  39.33 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  32.92 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  33.58 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  41.18 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  41.18 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  41.18 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  41.18 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  40.7 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  32.85 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  41.18 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  33.82 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  41.18 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  37.63 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  41.18 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  37.36 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  43.94 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  41.18 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  41.18 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  28.74 
 
 		 390 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  43.48 
 
 		 271 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  35.23 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  43.48 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  39.44 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 639 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 274 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0631  MerR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  46.38 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  34.26 
 
 		 253 aa  54.7  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3623  MerR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 274 aa  54.7  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  38.54 
 
 		 135 aa  53.9  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  28.95 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  28.68 
 
 		 314 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 268 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  34.02 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 254 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3049  MerR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 335 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 252 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 630 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 659 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 630 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 648 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  46.55 
 
 		 315 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 252 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 253 aa  52.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0461  MerR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0313707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  37.36 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  42.03 
 
 		 141 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 166 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 135 aa  52.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1749  MerR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 241 aa  52  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.682518  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 343 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>