More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0631 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0631  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  308  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2070  MerR family transcriptional regulator  66.91 
 
 		 140 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00505229  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2087  MerR family transcriptional regulator  66.91 
 
 		 140 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2133  MerR family transcriptional regulator  66.91 
 
 		 140 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0098213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3271  transcriptional regulator, MerR family  34.43 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0868413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0734  regulatory protein, MerR  40.48 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.308445  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5793  transcriptional regulator, MerR family  37.1 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4471  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  44.79 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4984  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4260  MerR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.49412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6164  transcriptional regulator, MerR family  43.94 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000248  transcriptional regulator  34.75 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0954  MerR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0450773  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4691  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5668  transcriptional regulator, MerR family  35.4 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67550  putative transcriptional regulator  39.34 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0955895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5849  putative transcriptional regulator  40.65 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00369897  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0423  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2534  transcriptional regulator, MerR family  28.7 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000567314  normal  0.0526863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4236  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4130  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2614  MerR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  33.63 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2129  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  28.12 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1480  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  35.14 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00810919  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4022  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605309  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3541  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 268 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3152  MerR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.335124  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1905  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.380273  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01184  Transcriptional regulator, MerR family protein  34.48 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06555  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  32.43 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1494  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  52.54 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  32.31 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  31.4 
 
 		 183 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1546  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.548833  normal  0.109608 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000675  redox-sensitive transcriptional activator soxR  32.43 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1460  transcriptional regulator, MerR family  32.23 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3920  MerR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3439  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  32.56 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  27.55 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  34.03 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1612  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  37.25 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  29.77 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0382  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  40.2 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2579  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136218  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  30 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  30 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  29.1 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  27.78 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1029  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  40.4 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 252 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  25.81 
 
 		 253 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3642  transcriptional regulator, MerR family  34.43 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3347  MerR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  29.13 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 253 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  32.06 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4462  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  29.6 
 
 		 129 aa  57  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 391 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  34.48 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1915  putative transcriptional regulator, MerR family  44.32 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3280  MerR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>