More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5793 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5793  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0734  regulatory protein, MerR  48.57 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.308445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4209  putative transcriptional regulator, MerR family  44.92 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  hitchhiker  0.000986554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6425  transcriptional regulator, MerR family  38.74 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0631  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  34.48 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000248  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4462  MerR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0461  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0313707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000376  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  36.08 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4022  MerR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605309  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2614  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3541  MerR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3099  MerR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00609185  decreased coverage  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5291  transcriptional regulator, MerR family  46.97 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2070  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00505229  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2133  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0098213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2087  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183046  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4201  MerR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952252 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2851  transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4691  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3439  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1905  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.380273  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4130  MerR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4236  MerR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2996  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4260  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.49412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0423  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0102  regulatory protein, MerR  39.39 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0157  MerR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1460  transcriptional regulator, MerR family  31.4 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0382  MerR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3063  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.858131  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1990  transcriptional regulator, MerR family  35.25 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4471  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.71 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882257 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2866  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0537  MerR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.400616  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5849  putative transcriptional regulator  35.9 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00369897  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0576  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0456359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02350  transcriptional regulator, MerR family  36.61 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0160379  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1994  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4023  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38430  regulatory gene of gnyRDBHAL cluster, GnyR  32.04 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0035  MerR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 142 aa  57  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2311  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113317  normal  0.278177 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  31.97 
 
 		 167 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 167 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  34.43 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2569  MerR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3653  MerR family transcriptional regulator  33 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3920  MerR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4735  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3273  regulatory protein GnyR  32.04 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2579  MerR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136218  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2924  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3269  MerR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4273  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2683  MerR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.903809  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1858  MerR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15558  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2902  regulatory protein, MerR  33.06 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0248  MerR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.849473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2694  MerR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2201  MerR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0035  MerR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0876  MerR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  30.58 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02411  Transcriptional regulator, MerR family protein  36.49 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1459  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.425414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  37.27 
 
 		 449 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  34.74 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2796  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3222  MerR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.012049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4372  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05481  hypothetical protein  39.06 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2120  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00663209  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67550  putative transcriptional regulator  36.59 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0955895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0032  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2827  MerR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1531  transcriptional regulator, MerR family  30.69 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3141  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  31.09 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1898  transcriptional regulator, putative  30.69 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1720  MerR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2393  MerR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>