More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4691 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4691  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  315  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1990  transcriptional regulator, MerR family  57.75 
 
 		 147 aa  164  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0423  MerR family transcriptional regulator  56.03 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2579  MerR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 143 aa  151  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136218  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01184  Transcriptional regulator, MerR family protein  56.69 
 
 		 137 aa  150  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4273  MerR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 139 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67550  putative transcriptional regulator  64.1 
 
 		 141 aa  147  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0955895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1595  MerR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.146181 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2682  putative regulatory protein  56.69 
 
 		 172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.537318  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2683  MerR family transcriptional regulator  60.33 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.903809  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0248  MerR family transcriptional regulator  60.33 
 
 		 183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.849473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2694  MerR family transcriptional regulator  60.33 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1858  MerR family transcriptional regulator  60.33 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15558  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3269  MerR family transcriptional regulator  60.33 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0035  MerR family transcriptional regulator  60.33 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2902  regulatory protein, MerR  55.12 
 
 		 143 aa  144  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0035  MerR family transcriptional regulator  59.5 
 
 		 142 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0033  MerR family transcriptional regulator  58.4 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3837  MerR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 139 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265561  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5849  putative transcriptional regulator  61.54 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00369897  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4022  MerR family transcriptional regulator  57.6 
 
 		 141 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605309  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3541  MerR family transcriptional regulator  57.6 
 
 		 141 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1905  MerR family transcriptional regulator  57.6 
 
 		 141 aa  141  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.380273  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4462  MerR family transcriptional regulator  57.6 
 
 		 141 aa  140  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3589  MerR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 137 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4236  MerR family transcriptional regulator  56 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2837  MerR family transcriptional regulator  56 
 
 		 133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  56 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4130  MerR family transcriptional regulator  56 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3439  MerR family transcriptional regulator  54.03 
 
 		 136 aa  134  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3347  MerR family transcriptional regulator  51.2 
 
 		 144 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000248  transcriptional regulator  50 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2614  MerR family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0382  MerR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1460  transcriptional regulator, MerR family  49.59 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4260  MerR family transcriptional regulator  50.42 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.49412 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2311  transcriptional regulator, MerR family  44.72 
 
 		 135 aa  97.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113317  normal  0.278177 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2087  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2133  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0098213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2070  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00505229  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  34.92 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3210  MerR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.303617  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  33.82 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2870  transcriptional regulator, MerR family  30.25 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0631  MerR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  34.35 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  40.34 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1130  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.54 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3218  transcriptional regulator, MerR family  34.4 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.54 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3642  transcriptional regulator, MerR family  34.71 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  32.54 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.54 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  32.54 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0734  regulatory protein, MerR  31.08 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.308445  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.54 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.54 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3141  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.17 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.23 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1915  putative transcriptional regulator, MerR family  36.09 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.54 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  32.54 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1098  transcriptional regulator, MerR family  34.4 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.23 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.23 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.23 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.23 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  37.01 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  34.71 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5793  transcriptional regulator, MerR family  35.48 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1816  MerR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0245036  normal  0.855302 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  34.71 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0495  MerR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06555  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  30.63 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3152  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.335124  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  34.4 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4209  putative transcriptional regulator, MerR family  29.69 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  hitchhiker  0.000986554 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000675  redox-sensitive transcriptional activator soxR  30.63 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.68 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3620  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.065575  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5536  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4747  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623543 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1546  MerR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.548833  normal  0.109608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  35.51 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  36.15 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3972  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  33.59 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5668  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  34.15 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>