More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2902 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2902  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 143 aa  290  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2682  putative regulatory protein  77.1 
 
 		 172 aa  213  7e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.537318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1990  transcriptional regulator, MerR family  63.08 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2579  MerR family transcriptional regulator  63.28 
 
 		 143 aa  167  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136218  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1595  MerR family transcriptional regulator  61.83 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.146181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4273  MerR family transcriptional regulator  61.83 
 
 		 139 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0423  MerR family transcriptional regulator  61.24 
 
 		 140 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2694  MerR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2683  MerR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.903809  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0035  MerR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1858  MerR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15558  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3269  MerR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0248  MerR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 183 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.849473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3837  MerR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265561  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0035  MerR family transcriptional regulator  62.81 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0033  MerR family transcriptional regulator  61.6 
 
 		 164 aa  160  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01184  Transcriptional regulator, MerR family protein  57.14 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3589  MerR family transcriptional regulator  59.69 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3541  MerR family transcriptional regulator  58.4 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4022  MerR family transcriptional regulator  58.4 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605309  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4462  MerR family transcriptional regulator  58.4 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2837  MerR family transcriptional regulator  56.56 
 
 		 133 aa  147  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3347  MerR family transcriptional regulator  56.8 
 
 		 144 aa  147  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3439  MerR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  56 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4236  MerR family transcriptional regulator  56 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4130  MerR family transcriptional regulator  56 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5849  putative transcriptional regulator  61.54 
 
 		 141 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00369897  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4691  MerR family transcriptional regulator  55.12 
 
 		 159 aa  144  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67550  putative transcriptional regulator  62.39 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0955895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1905  MerR family transcriptional regulator  55.2 
 
 		 141 aa  143  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.380273  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1460  transcriptional regulator, MerR family  47.18 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0382  MerR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000248  transcriptional regulator  50.79 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2614  MerR family transcriptional regulator  52 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2311  transcriptional regulator, MerR family  49.6 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113317  normal  0.278177 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4260  MerR family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 141 aa  117  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.49412 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2125  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.43 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0226644  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  35.43 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  30.6 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3680  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000675  redox-sensitive transcriptional activator soxR  35.29 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2060  transcriptional regulator SoxR  33.33 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4209  putative transcriptional regulator, MerR family  29.92 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  hitchhiker  0.000986554 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06555  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  34.45 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3210  MerR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.303617  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3642  transcriptional regulator, MerR family  34.17 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1130  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1579  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0323657  normal  0.536322 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1098  transcriptional regulator, MerR family  31.5 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3218  transcriptional regulator, MerR family  30.95 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2534  transcriptional regulator, MerR family  34.45 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000567314  normal  0.0526863 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  42.71 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.54 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3972  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5717  transcriptional regulator, MerR family  38 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4525  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.33 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0495  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292362  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1053  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0954  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0450773  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1915  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3152  MerR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.335124  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5668  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  30.4 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.37 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.37 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.37 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02196  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.61 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.37 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.37 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.37 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3280  MerR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  30.4 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.37 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03935  DNA-binding transcriptional dual regulator, Fe-S center for redox-sensing  32.48 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.015828  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3929  transcriptional regulator, MerR family  32.48 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1546  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.548833  normal  0.109608 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4581  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.48 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5566  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.48 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.953635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4616  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.48 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4305  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.48 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4517  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.48 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3397  MerR family transcriptional regulator  31 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.37 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>