More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0382 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0382  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  310  4.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1460  transcriptional regulator, MerR family  61.59 
 
 		 151 aa  199  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4260  MerR family transcriptional regulator  62.02 
 
 		 141 aa  167  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.49412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1990  transcriptional regulator, MerR family  60.45 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4462  MerR family transcriptional regulator  59.12 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320257  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2683  MerR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.903809  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0035  MerR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2694  MerR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3269  MerR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1858  MerR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15558  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2614  MerR family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3541  MerR family transcriptional regulator  56.43 
 
 		 141 aa  153  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4022  MerR family transcriptional regulator  56.43 
 
 		 141 aa  153  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605309  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0248  MerR family transcriptional regulator  61.98 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.849473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0035  MerR family transcriptional regulator  60.48 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01184  Transcriptional regulator, MerR family protein  55.2 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3347  MerR family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  56.43 
 
 		 141 aa  150  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4236  MerR family transcriptional regulator  56.43 
 
 		 141 aa  150  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4130  MerR family transcriptional regulator  56.43 
 
 		 141 aa  150  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0033  MerR family transcriptional regulator  60.48 
 
 		 164 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0423  MerR family transcriptional regulator  57.26 
 
 		 140 aa  147  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1905  MerR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 141 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.380273  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3439  MerR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 136 aa  143  9e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2579  MerR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 143 aa  141  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136218  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2682  putative regulatory protein  51.09 
 
 		 172 aa  140  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.537318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2902  regulatory protein, MerR  54.84 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67550  putative transcriptional regulator  60 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0955895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2837  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5849  putative transcriptional regulator  59.17 
 
 		 141 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00369897  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000248  transcriptional regulator  48.06 
 
 		 135 aa  134  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3589  MerR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 137 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4691  MerR family transcriptional regulator  48 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1595  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 139 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.146181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4273  MerR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 139 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3837  MerR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265561  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2311  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 135 aa  99.4  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113317  normal  0.278177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3680  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2060  transcriptional regulator SoxR  35.29 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3642  transcriptional regulator, MerR family  35.56 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3280  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4209  putative transcriptional regulator, MerR family  30.4 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  hitchhiker  0.000986554 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1915  putative transcriptional regulator, MerR family  35.46 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1579  MerR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0323657  normal  0.536322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  30.47 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4661  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.84 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4517  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.84 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4525  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.84 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4610  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.84 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.327282 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4611  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.84 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0111034  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  31.2 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001159  transcriptional regulator  29.92 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.33 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0734  regulatory protein, MerR  33.87 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.308445  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  34.38 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  30.53 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  34.11 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4525  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.88 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03935  DNA-binding transcriptional dual regulator, Fe-S center for redox-sensing  33.06 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.015828  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3929  transcriptional regulator, MerR family  33.06 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4581  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.06 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4616  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.06 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  29.92 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5566  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.06 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.953635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3964  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0321214 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03895  hypothetical protein  33.06 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0184757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3103  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  30.89 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4305  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.06 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0838  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0267  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2081  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0869  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4984  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  30.88 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1612  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  43.42 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4538  transcriptional activator for superoxide response; Fe-S center for redox-sensing (MerR family)  37.19 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485722  normal  0.455986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  32.82 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  33.06 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5793  transcriptional regulator, MerR family  31.97 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4471  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.61 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>