More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2579 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2579  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  280  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136218  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1990  transcriptional regulator, MerR family  67.97 
 
 		 147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0033  MerR family transcriptional regulator  67.14 
 
 		 164 aa  174  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0423  MerR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 140 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2902  regulatory protein, MerR  63.28 
 
 		 143 aa  167  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01184  Transcriptional regulator, MerR family protein  61.72 
 
 		 137 aa  167  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2683  MerR family transcriptional regulator  66.94 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.903809  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2694  MerR family transcriptional regulator  66.94 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0035  MerR family transcriptional regulator  66.94 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3269  MerR family transcriptional regulator  66.94 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1858  MerR family transcriptional regulator  66.94 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0248  MerR family transcriptional regulator  66.94 
 
 		 183 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.849473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0035  MerR family transcriptional regulator  66.12 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2682  putative regulatory protein  60.45 
 
 		 172 aa  159  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.537318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4022  MerR family transcriptional regulator  64 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605309  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3541  MerR family transcriptional regulator  64 
 
 		 141 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5849  putative transcriptional regulator  69.23 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00369897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67550  putative transcriptional regulator  69.23 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0955895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4462  MerR family transcriptional regulator  63.2 
 
 		 141 aa  155  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3347  MerR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1905  MerR family transcriptional regulator  62.4 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.380273  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4236  MerR family transcriptional regulator  61.6 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  61.6 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4130  MerR family transcriptional regulator  61.6 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3439  MerR family transcriptional regulator  56.39 
 
 		 136 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1595  MerR family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 139 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.146181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4691  MerR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2837  MerR family transcriptional regulator  60.66 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4273  MerR family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 139 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3837  MerR family transcriptional regulator  60.66 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265561  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3589  MerR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 137 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2614  MerR family transcriptional regulator  56 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0382  MerR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1460  transcriptional regulator, MerR family  48.2 
 
 		 151 aa  137  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000248  transcriptional regulator  49.26 
 
 		 135 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4260  MerR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.49412 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2311  transcriptional regulator, MerR family  47.97 
 
 		 135 aa  107  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113317  normal  0.278177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3680  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2060  transcriptional regulator SoxR  39.17 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3642  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1579  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0323657  normal  0.536322 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0225  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  35.29 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2125  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.52 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0226644  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  32.79 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000675  redox-sensitive transcriptional activator soxR  36 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06555  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  35.77 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3141  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.33 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0056  soxR protein  32.52 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0560475  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1053  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.582501 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03935  DNA-binding transcriptional dual regulator, Fe-S center for redox-sensing  35.9 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.015828  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3929  transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4525  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  35.9 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4616  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  35.9 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4581  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  35.9 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4305  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  35.9 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3964  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0321214 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03895  hypothetical protein  35.9 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0184757  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5566  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  35.9 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.953635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1612  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  49.25 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  31.75 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.75 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3152  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.335124  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4610  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  35.9 
 
 		 152 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.327282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4525  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  35.9 
 
 		 152 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4661  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  35.9 
 
 		 152 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4611  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  35.9 
 
 		 152 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0111034  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4517  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  35.9 
 
 		 152 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0713  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.979534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3280  MerR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  44.29 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  30.95 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3920  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3931  transcriptional regulator, MerR family  41.3 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  30.95 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  30.16 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2070  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00505229  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2087  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183046  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2133  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0098213 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2276  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101998  hitchhiker  0.00000024461 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  30.95 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  30.95 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0267  MerR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  30.95 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  30.95 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4538  transcriptional activator for superoxide response; Fe-S center for redox-sensing (MerR family)  35.56 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485722  normal  0.455986 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  30.95 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  30.95 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>