More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3152 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3152  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 131 aa  265  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.335124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3280  MerR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2534  transcriptional regulator, MerR family  31.15 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000567314  normal  0.0526863 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  37.8 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0157  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 167 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  38.54 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.9 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4462  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4022  MerR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605309  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3541  MerR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1905  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.380273  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  34.13 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  35.83 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4130  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4236  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  36.79 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  28.68 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  36.29 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  31.3 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.85 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2931  MerR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68732 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06555  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  31.4 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000675  redox-sensitive transcriptional activator soxR  30.58 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0713  MerR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.979534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1990  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0056  soxR protein  28.93 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0560475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5668  transcriptional regulator, MerR family  30.25 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  40.86 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  50 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  40.82 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5717  transcriptional regulator, MerR family  29.77 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  36.29 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2837  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  33.33 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3920  MerR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  32.79 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1612  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.25 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2788  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  34.91 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67550  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0955895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2967  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  34.95 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01780  transcriptional regulator, MerR family  28.12 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.95899 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2311  transcriptional regulator, MerR family  47.69 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113317  normal  0.278177 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3819  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0221891 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  33.59 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3642  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2683  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.903809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3269  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0035  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1858  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2694  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0033  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0035  MerR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  34.68 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3439  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  34.15 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  32.06 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5849  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00369897  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2070  MerR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00505229  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2133  MerR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0098213 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  34.23 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.21 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2087  MerR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183046  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.21 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>