More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3280 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3280  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 139 aa  288  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2534  transcriptional regulator, MerR family  45.76 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000567314  normal  0.0526863 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3152  MerR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.335124  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1612  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  36 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06555  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  35.77 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000675  redox-sensitive transcriptional activator soxR  34.96 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4594  MerR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608405 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0056  soxR protein  36.59 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0560475  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1003  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0382  MerR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4130  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.442587  normal  0.0543283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5536  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3620  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.065575  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4747  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623543 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1460  transcriptional regulator, MerR family  35.54 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3929  MerR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3680  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2060  transcriptional regulator SoxR  32.81 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2276  MerR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101998  hitchhiker  0.00000024461 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4260  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.49412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0157  MerR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5668  transcriptional regulator, MerR family  29.27 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0035  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1579  MerR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0323657  normal  0.536322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1287  MerR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1480  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  29.27 
 
 		 148 aa  76.6  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00810919  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1029  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.81 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2683  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.903809  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2694  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1905  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.380273  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0035  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3269  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1858  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15558  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3642  transcriptional regulator, MerR family  30.89 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1546  MerR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.548833  normal  0.109608 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0248  MerR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.849473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5849  putative transcriptional regulator  38.18 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00369897  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0033  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3439  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1582  MerR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4022  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605309  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  30.16 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2806  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.08 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.37472  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3541  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000248  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1189  MerR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0926  transcriptional regulator, MerR family  31.71 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.129238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4236  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67550  putative transcriptional regulator  35.59 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0955895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4130  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3920  MerR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1130  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1990  transcriptional regulator, MerR family  33.9 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02196  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.68 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0738  transcriptional regulator, MerR family  28.23 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  32.85 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  35.4 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0408  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.08 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4462  MerR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4538  transcriptional activator for superoxide response; Fe-S center for redox-sensing (MerR family)  28.8 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485722  normal  0.455986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2837  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  33.61 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.61 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10940  transcriptional regulator, MerR family  30.89 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  33.07 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  28.23 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1373  MerR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1915  putative transcriptional regulator, MerR family  32.52 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4471  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  30.08 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882257 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3141  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  28.46 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1053  MerR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 173 aa  70.5  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  31.13 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5717  transcriptional regulator, MerR family  30.08 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3439  MerR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 150 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.408622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4984  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1511  regulatory protein, MerR  37.74 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  34.11 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  33.06 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1995  MerR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.414348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  34.11 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3164  MerR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  34.11 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  34.11 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3026  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.11 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1266  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.11 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0668949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>