More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5849 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5849  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  270  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00369897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67550  putative transcriptional regulator  92.91 
 
 		 141 aa  229  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0955895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1990  transcriptional regulator, MerR family  74.26 
 
 		 147 aa  201  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0423  MerR family transcriptional regulator  70.15 
 
 		 140 aa  180  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0033  MerR family transcriptional regulator  74.6 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0035  MerR family transcriptional regulator  73.39 
 
 		 142 aa  173  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2683  MerR family transcriptional regulator  73.39 
 
 		 142 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.903809  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1858  MerR family transcriptional regulator  73.39 
 
 		 142 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15558  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3269  MerR family transcriptional regulator  73.39 
 
 		 142 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2694  MerR family transcriptional regulator  73.39 
 
 		 142 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3541  MerR family transcriptional regulator  65.25 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4022  MerR family transcriptional regulator  65.25 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605309  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0248  MerR family transcriptional regulator  73.77 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.849473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0035  MerR family transcriptional regulator  72.58 
 
 		 142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1905  MerR family transcriptional regulator  63.83 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.380273  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2837  MerR family transcriptional regulator  69.53 
 
 		 133 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4236  MerR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 141 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 141 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4130  MerR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 141 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2579  MerR family transcriptional regulator  67.97 
 
 		 143 aa  167  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136218  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4462  MerR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2682  putative regulatory protein  64.18 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.537318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01184  Transcriptional regulator, MerR family protein  61.54 
 
 		 137 aa  163  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2902  regulatory protein, MerR  62.02 
 
 		 143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1595  MerR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 139 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.146181 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3347  MerR family transcriptional regulator  59.4 
 
 		 144 aa  153  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4273  MerR family transcriptional regulator  55.64 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4691  MerR family transcriptional regulator  61.42 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3837  MerR family transcriptional regulator  56.59 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265561  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3589  MerR family transcriptional regulator  53.38 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0382  MerR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3439  MerR family transcriptional regulator  59.68 
 
 		 136 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1460  transcriptional regulator, MerR family  55.12 
 
 		 151 aa  143  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4260  MerR family transcriptional regulator  59.35 
 
 		 141 aa  139  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.49412 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2614  MerR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000248  transcriptional regulator  52.38 
 
 		 135 aa  136  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2311  transcriptional regulator, MerR family  57.81 
 
 		 135 aa  134  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113317  normal  0.278177 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0056  soxR protein  33.87 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0560475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  38.85 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3141  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  39.34 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06555  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  36.61 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5717  transcriptional regulator, MerR family  43.24 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2060  transcriptional regulator SoxR  37.01 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1546  MerR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.548833  normal  0.109608 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000675  redox-sensitive transcriptional activator soxR  35.71 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3680  MerR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2276  MerR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101998  hitchhiker  0.00000024461 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3642  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3280  MerR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1579  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0323657  normal  0.536322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3920  MerR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0225  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  36.94 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1915  putative transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10940  transcriptional regulator, MerR family  39.64 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1053  MerR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2125  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.26 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0226644  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1029  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  37.3 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2087  MerR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183046  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1565  transcriptional regulator, MerR family protein  29.03 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2070  MerR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00505229  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35170  putative redox-sensing activator of soxS  36.89 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2133  MerR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0098213 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5566  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.71 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.953635  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03935  DNA-binding transcriptional dual regulator, Fe-S center for redox-sensing  38.71 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.015828  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3929  transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4616  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.71 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3964  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0321214 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4581  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.71 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4525  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.71 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4305  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.71 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4538  transcriptional activator for superoxide response; Fe-S center for redox-sensing (MerR family)  37.6 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485722  normal  0.455986 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03895  hypothetical protein  38.71 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0184757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  38.39 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4610  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.71 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.327282 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4517  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.71 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1373  MerR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4525  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.71 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4661  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.71 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3972  MerR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4611  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.71 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0111034  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2967  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  36.59 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3152  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.335124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0631  MerR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0267  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1189  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  41.23 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1612  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  55.56 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0954  MerR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0450773  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4471  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  37.1 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3271  transcriptional regulator, MerR family  36.75 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0868413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3439  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.408622 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01780  transcriptional regulator, MerR family  38.84 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.95899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1287  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5793  transcriptional regulator, MerR family  36.44 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0926  transcriptional regulator, MerR family  37.17 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.129238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4130  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.442587  normal  0.0543283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>