More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0713 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0713  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
125 aa  250  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.979534  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2788  MerR family transcriptional regulator  54.24 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291885  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2967  MerR family transcriptional regulator  54.24 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2733  MerR family transcriptional regulator  45.05 
 
 
135 aa  88.6  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3871  MerR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
117 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  37.29 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  39.83 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  38.14 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  36.21 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  38.14 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  36.21 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6040  MerR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.98 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  38.98 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  36.44 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  38.98 
 
 
129 aa  70.1  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  40.68 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  38.28 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4498  MerR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119505  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  38.14 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  36.44 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
159 aa  67  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3152  MerR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
131 aa  67  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.335124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  34.75 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2526  MerR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120952  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.29 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0905  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.131454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3690  regulatory protein, MerR  33.62 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.05 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  49.32 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  45.59 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  36.28 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.61 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  36.44 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1798  regulatory protein, MerR  34.02 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0455207  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.19 
 
 
132 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  34.48 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  34.48 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.11 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  35.9 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
136 aa  62  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2562  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3242  transcriptional regulator, MerR family  34.75 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.9 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
174 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
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NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
149 aa  61.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  37.17 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
182 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  33.05 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal 
 
 
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NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
166 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_1805  transcriptional regulator, MerR family  48.57 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.665763 
 
 
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NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  38.94 
 
 
133 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  33.05 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.733746 
 
 
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