More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4209 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4209  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 145 aa  296  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  hitchhiker  0.000986554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0734  regulatory protein, MerR  54.31 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.308445  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5793  transcriptional regulator, MerR family  44.92 
 
 		 139 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1460  transcriptional regulator, MerR family  26.87 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4260  MerR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.49412 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0382  MerR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2902  regulatory protein, MerR  29.92 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  34.13 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  33.86 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0423  MerR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  38.02 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2682  putative regulatory protein  28.35 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.537318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3439  MerR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  39.67 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  41.1 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1130  MerR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  43.68 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.06 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01184  Transcriptional regulator, MerR family protein  29.13 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  31.4 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  30.58 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  43.68 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.58 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4691  MerR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  30.71 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.25 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  30.58 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.25 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2614  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  31.85 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  31.3 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  28.24 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  42.47 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4022  MerR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605309  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3541  MerR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  33.06 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  29.92 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  43.84 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  33.94 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  29.92 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  29.69 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  43.48 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1905  MerR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.380273  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4236  MerR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.33 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3389  MerR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879982 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4130  MerR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2990  MerR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645103  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  32.28 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  33.02 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3763  transcriptional regulator, MerR family  36.47 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503955  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.47 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1595  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.146181 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  33.02 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  32.28 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  29.85 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  28.36 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  27.41 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  28.36 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3219  MerR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199693  normal  0.39103 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  29.17 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  28.36 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3033  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0661406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1990  transcriptional regulator, MerR family  28.91 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3837  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265561  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  46.27 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>