More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3763 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3763  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 132 aa  253  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503955  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 251 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 251 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  38.89 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1773  transcriptional regulator, MerR family  48.53 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2139  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  38.1 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0419  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3096  MerR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302029  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3393  transcriptional regulator, putative  31.91 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 252 aa  60.1  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3173  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 135 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3157  MerR family regulatory protein  31.91 
 
 		 135 aa  60.1  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3067  MerR family regulatory protein  31.91 
 
 		 135 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  60.1  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  43.55 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  44.19 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0951  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0159877  hitchhiker  0.00000555136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  41.54 
 
 		 336 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  30.25 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  38.96 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 		 354 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 334 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2189  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  33.75 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 254 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 254 aa  57.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 252 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 254 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  34.94 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 253 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 253 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 339 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 253 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 253 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  34.57 
 
 		 251 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.29 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  44.44 
 
 		 278 aa  57.4  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  35.14 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  41.86 
 
 		 262 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  39.74 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0139  transcriptional regulator, MerR family  36.17 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4209  putative transcriptional regulator, MerR family  36.47 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  hitchhiker  0.000986554 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  36.52 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 343 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 342 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0032  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 343 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  41.94 
 
 		 326 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 300 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  34.15 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  38.1 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5373  transcriptional regulator, MerR family  33.78 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  34.19 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  34.26 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  39.13 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 262 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 345 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 186 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 		 303 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>