More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2139 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2139  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
135 aa  277  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3173  transcriptional regulator  91.85 
 
 
135 aa  234  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3157  MerR family regulatory protein  91.85 
 
 
135 aa  234  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3067  MerR family regulatory protein  91.85 
 
 
135 aa  234  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3393  transcriptional regulator, putative  91.11 
 
 
135 aa  231  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3096  MerR family transcriptional regulator  86.67 
 
 
134 aa  226  7e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3423  transcriptional regulator  92.06 
 
 
126 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3392  putative transcriptional regulator  92.06 
 
 
126 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3397  putative transcriptional regulator  92.06 
 
 
126 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3371  putative transcriptional regulator  91.27 
 
 
126 aa  216  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1854  putative transcriptional regulator  91.27 
 
 
126 aa  215  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0419  MerR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
146 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107138  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1773  transcriptional regulator, MerR family  40.85 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  36.57 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3763  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  33.88 
 
 
144 aa  62  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  31.54 
 
 
129 aa  60.5  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
281 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  30.17 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  30.47 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
270 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
134 aa  57.4  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  31.4 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  30.77 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
143 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  30.08 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  31.25 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 
155 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  35.9 
 
 
133 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  33.62 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  32.76 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  32.71 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  30.08 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
163 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  33.62 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  33.62 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  29.77 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
166 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3192  MerR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  25.6 
 
 
288 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  32.71 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  32.71 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  32.71 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  30.53 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  27.36 
 
 
169 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  30.39 
 
 
272 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  35.34 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0923  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190958  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1816  MerR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
154 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0245036  normal  0.855302 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0023  MerR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
239 aa  53.9  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  34.17 
 
 
132 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  27.27 
 
 
170 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2051  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  41.27 
 
 
234 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2421  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  31.25 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.732276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
146 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>