More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3393 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3393  transcriptional regulator, putative  100 
 
 
135 aa  274  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3173  transcriptional regulator  99.26 
 
 
135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3157  MerR family regulatory protein  99.26 
 
 
135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3067  MerR family regulatory protein  99.26 
 
 
135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2139  MerR family transcriptional regulator  91.11 
 
 
135 aa  254  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3397  putative transcriptional regulator  99.21 
 
 
126 aa  253  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3423  transcriptional regulator  99.21 
 
 
126 aa  253  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3392  putative transcriptional regulator  99.21 
 
 
126 aa  253  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3096  MerR family transcriptional regulator  93.33 
 
 
134 aa  241  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302029  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3371  putative transcriptional regulator  97.62 
 
 
126 aa  227  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1854  putative transcriptional regulator  97.62 
 
 
126 aa  225  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0419  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
146 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107138  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1773  transcriptional regulator, MerR family  41.55 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  35.56 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  33.83 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3763  transcriptional regulator, MerR family  32.85 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503955  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
143 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
143 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
144 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
281 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  32.23 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  32.03 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  31.3 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  30.17 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  30.77 
 
 
129 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
270 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
154 aa  57  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  29.85 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
154 aa  57  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  32.06 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  32.09 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  33.96 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
163 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  29.73 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
133 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  33.04 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  31.11 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  34.62 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  37.96 
 
 
170 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  35.34 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2318  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  32.48 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  29.32 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  31.34 
 
 
157 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  35 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  34.48 
 
 
148 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
166 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0023  MerR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
239 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  29.32 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
144 aa  53.9  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  29.32 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2240  transcriptional regulator  37.5 
 
 
125 aa  53.9  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 
234 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  29.32 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  27.36 
 
 
169 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 
249 aa  53.9  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.71 
 
 
149 aa  53.9  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  28.28 
 
 
270 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
154 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0923  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
119 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190958  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  36.54 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  35.58 
 
 
253 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  28.12 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  35.09 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3192  MerR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  28.57 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>