More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3192 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3192  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 126 aa  256  7e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  76.19 
 
 		 126 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  60.8 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  62.7 
 
 		 163 aa  160  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  61.9 
 
 		 169 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 166 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 182 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  60.32 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  58.73 
 
 		 133 aa  153  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  58.73 
 
 		 129 aa  153  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1130  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 140 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  47.62 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  46.83 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  46.83 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  46.83 
 
 		 129 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 133 aa  123  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 130 aa  120  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 		 129 aa  120  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 136 aa  117  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44.88 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  47.24 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  46.46 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 134 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  41.73 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0089  MerR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  41.73 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  44.88 
 
 		 132 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.94 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  40.94 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.94 
 
 		 144 aa  105  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.37 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  37.8 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 175 aa  102  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  41.73 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2318  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  39.37 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1950  MerR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.329857 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  39.2 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  42.06 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3242  transcriptional regulator, MerR family  42.06 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.48 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.27 
 
 		 154 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.27 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.27 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.27 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.27 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 154 aa  100  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.8 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  39.68 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  39.37 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0495  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 139 aa  99.4  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>