More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0419 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0419  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  292  9e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107138  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1773  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2139  MerR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3393  transcriptional regulator, putative  37.96 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3173  transcriptional regulator  37.96 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3157  MerR family regulatory protein  37.96 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3067  MerR family regulatory protein  37.96 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3096  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302029  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3371  putative transcriptional regulator  35.16 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3392  putative transcriptional regulator  35.16 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3423  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3397  putative transcriptional regulator  35.16 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1854  putative transcriptional regulator  35.16 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 253 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3763  transcriptional regulator, MerR family  53.85 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503955  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  38.64 
 
 		 254 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  36.28 
 
 		 252 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  31.36 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  31.36 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 281 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  30.51 
 
 		 269 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  30.97 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  31.36 
 
 		 269 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 173 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  40 
 
 		 270 aa  57  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  32.69 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  28.47 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  46.88 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  31.53 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 269 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  29.79 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  28.47 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4260  MerR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.49412 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2779  MerR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 185 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 		 177 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  40 
 
 		 398 aa  53.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  46.88 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  31.73 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  28.78 
 
 		 283 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  35.44 
 
 		 249 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 149 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3862  precorrin-8X methylmutase  32.38 
 
 		 368 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  31.97 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 277 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2125  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  31.48 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0226644  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  46.15 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  46.88 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  41.27 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 		 251 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  34.58 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  27.74 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  30.08 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  27.74 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  30.08 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  27.74 
 
 		 176 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  29.46 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 		 255 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  27.35 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 253 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 258 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  46.88 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  39.73 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  27.74 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  44.44 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  27.74 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>