More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2824 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 251 aa  512  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  32.82 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  33.59 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  31.27 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  30.12 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  31.6 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  30.65 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  30.77 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  31.05 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  30.65 
 
 		 243 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  30.65 
 
 		 243 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  30.65 
 
 		 243 aa  98.6  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  30.24 
 
 		 243 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  27.6 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 245 aa  96.3  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  30.28 
 
 		 244 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  38.97 
 
 		 284 aa  92  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  28.02 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  27.95 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 288 aa  88.6  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  36.59 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  40.4 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  27.34 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  57.75 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  36.19 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  36.07 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  40.2 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  26.95 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  40.18 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  27.56 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  26.29 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  40.2 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  39.22 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  28.85 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  34.43 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  37.25 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  25.4 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  26.75 
 
 		 252 aa  72  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  36.27 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  35.14 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  31.79 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  39.81 
 
 		 133 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  44.78 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  35.56 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1664  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  26.37 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  45.71 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  26.36 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  41.57 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  36.54 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  39 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  40.51 
 
 		 191 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 152 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 155 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  31.96 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 157 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  27 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  36.54 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  35.92 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  24.81 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  34.26 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  38.14 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0139  transcriptional regulator, MerR family  36.05 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  40.58 
 
 		 336 aa  62  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 339 aa  62  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>