More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1866 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  505  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1749  MerR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 241 aa  142  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.682518  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2061  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2531  MerR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00201177  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2583  regulatory protein MerR  30.99 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1562  transcriptional regulator  33.81 
 
 		 160 aa  88.6  8e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  33.58 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 277 aa  72  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  47.89 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4916  multidrug-efflux transporter 1 regulator  50 
 
 		 64 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  48.57 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  45.71 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  34.84 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  30.41 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  45.56 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  33.01 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  45.71 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  33.98 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  27.51 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0079  transcriptional regulator  35.4 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  37.17 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  42.67 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  37.86 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  32.17 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  40.85 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  44.78 
 
 		 132 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  46.15 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  34.83 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  34.83 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  43.06 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  34.83 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  41.25 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  45.59 
 
 		 133 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  32.73 
 
 		 159 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  34.31 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 139 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  34.83 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  39.71 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  37.97 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  46.15 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  46.15 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1724  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  46.15 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  46.15 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  48.44 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  46.15 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  46.15 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  38.32 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  32.11 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  28.4 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  38.64 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  37.11 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  46.27 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  32.04 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 250 aa  62  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  46.15 
 
 		 243 aa  62  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  46.15 
 
 		 243 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  28.7 
 
 		 295 aa  62  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 290 aa  62  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>