More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6982 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 270 aa  535  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  65.79 
 
 		 292 aa  345  3e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  64.31 
 
 		 276 aa  344  8e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  69.81 
 
 		 270 aa  338  8e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  63.88 
 
 		 264 aa  330  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  48.72 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  51.46 
 
 		 276 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  45.2 
 
 		 297 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  40.36 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  40.59 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  35.86 
 
 		 258 aa  118  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  27.14 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  24.54 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  30.88 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  32.73 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  30.45 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  34.41 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  32.33 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  22.43 
 
 		 273 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 270 aa  95.9  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  32.39 
 
 		 272 aa  95.1  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  21.61 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  24.81 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  21.61 
 
 		 269 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 276 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 276 aa  92.4  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  23.94 
 
 		 276 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  32.07 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  22.74 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  23.47 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  23.76 
 
 		 276 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 270 aa  89.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  23.1 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  22.51 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  22.26 
 
 		 269 aa  86.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  20.51 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  20.88 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  20.88 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  32.42 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  20.51 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  20.51 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  46.67 
 
 		 355 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  27.97 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  31.88 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  32.09 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  32.07 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  25.98 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  20.88 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  20.78 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  23.91 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  36.84 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 261 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  42.22 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  38.06 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  25.53 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  24.25 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  31.82 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  39.05 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  23.66 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 129 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  37.62 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  32.99 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  37.78 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  53.12 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  37 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  36 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 161 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  40.19 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  43.59 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  21.03 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2029  regulatory protein, MerR  36.64 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115977  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  34.96 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  25.93 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  40.34 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  48.05 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  34 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>