284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13400 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 346 aa  670    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  46.92 
 
 		 399 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  39.67 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  49.43 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  38.33 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  45.98 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  43.93 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  50.75 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  36.19 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  45.45 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  40.19 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  39.45 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  38.68 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  49.28 
 
 		 262 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  49.25 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  50.75 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  37.86 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  48.53 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.22 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  50.75 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  27.78 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  40.28 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  27.78 
 
 		 276 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  39.58 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 276 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 276 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  27.34 
 
 		 276 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  27.34 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  38.14 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_248  DNA polymerase III domain protein  25.41 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.864877  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  27.94 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  37.37 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.64 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  36.51 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 161 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.31 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2029  regulatory protein, MerR  45.59 
 
 		 178 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115977  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  47.76 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  31.18 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  27.78 
 
 		 269 aa  57  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  30.3 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.39 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.08 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.75 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13800  predicted transcriptional regulator  49.15 
 
 		 297 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.91 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  32.46 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0888  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  32.76 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  31.32 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00020  DNA polymerase III, beta subunit  26.88 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  25.91 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0188  DNA polymerase III beta subunit family protein  25.19 
 
 		 419 aa  53.5  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 269 aa  53.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  37.62 
 
 		 361 aa  53.1  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  23.94 
 
 		 269 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0439  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 228 aa  53.1  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0002  DNA polymerase III subunit beta  29 
 
 		 408 aa  53.1  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2402  transcriptional regulator, MerR family  38.61 
 
 		 272 aa  53.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  hitchhiker  0.00583984 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0738  DNA polymerase III beta subunit family protein  38.4 
 
 		 433 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2087  MerR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 140 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2133  MerR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 140 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0098213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2070  MerR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 140 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00505229  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.77 
 
 		 377 aa  52.8  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 269 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  34.82 
 
 		 282 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 279 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000269969  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  22.54 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  22.54 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 133 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  36.56 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  31.97 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  35.58 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.5 
 
 		 376 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.58 
 
 		 375 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000684448  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16760  predicted transcriptional regulator  29.25 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.498002 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  41.82 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 270 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  36.72 
 
 		 365 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3058  transcriptional regulator, MerR family  34.03 
 
 		 136 aa  50.4  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  27.88 
 
 		 253 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>