More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9328 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 365 aa  711    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3544  DNA polymerase III subunit beta  69.42 
 
 		 364 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.908435  normal  0.835762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  54.01 
 
 		 375 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000684448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  52.12 
 
 		 379 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0086  DNA polymerase III subunit beta  52.38 
 
 		 379 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0002  DNA polymerase III, beta subunit  54.52 
 
 		 379 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000269969  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  50.92 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0002  DNA polymerase III subunit beta  51.99 
 
 		 378 aa  368  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0002  DNA polymerase III subunit beta  48.46 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0135269  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5295  DNA polymerase III, beta subunit  49.74 
 
 		 384 aa  359  4e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0002  DNA polymerase III subunit beta  51.46 
 
 		 408 aa  357  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00020  DNA polymerase III, beta subunit  50.53 
 
 		 376 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  50.8 
 
 		 376 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  49.47 
 
 		 376 aa  348  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000849521  normal  0.168185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  49.07 
 
 		 377 aa  347  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0002  DNA polymerase III, beta subunit  49.48 
 
 		 386 aa  345  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00020  DNA polymerase III, beta subunit  47.33 
 
 		 374 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218776  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0002  DNA polymerase III, beta subunit  49.73 
 
 		 378 aa  342  5.999999999999999e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  46.51 
 
 		 374 aa  332  9e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  46.24 
 
 		 374 aa  332  9e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  45.34 
 
 		 388 aa  331  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  46.23 
 
 		 398 aa  330  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  45.81 
 
 		 408 aa  327  3e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00020  DNA polymerase III, beta subunit  46.4 
 
 		 378 aa  326  4.0000000000000003e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  44.94 
 
 		 396 aa  322  5e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  45.19 
 
 		 398 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0003  DNA polymerase III, beta subunit  45 
 
 		 402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  45.19 
 
 		 398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  45.19 
 
 		 398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  46.37 
 
 		 398 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0003  DNA polymerase III, beta subunit  48.14 
 
 		 377 aa  316  4e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000000000316606  hitchhiker  0.00386911 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  43.56 
 
 		 402 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0002  DNA polymerase III, beta subunit  49.33 
 
 		 383 aa  313  3.9999999999999997e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435185 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  44.3 
 
 		 387 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  46.81 
 
 		 378 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0002  DNA polymerase III, beta subunit  47.07 
 
 		 377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00244113  unclonable  0.0000000186271 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00020  DNA polymerase III subunit beta  47.48 
 
 		 379 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251098  normal  0.535088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0003  DNA polymerase III, beta subunit  44.94 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00020  DNA polymerase III, beta subunit  44.59 
 
 		 374 aa  301  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0002  DNA polymerase III subunit beta  39.52 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000348637  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1435  DNA polymerase III subunit beta  38.61 
 
 		 374 aa  265  8e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.674698  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0044  DNA polymerase III, beta subunit  37 
 
 		 374 aa  263  4e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5871  DNA polymerase III, beta subunit  39.45 
 
 		 404 aa  225  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0738  DNA polymerase III beta subunit family protein  37.53 
 
 		 433 aa  225  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  31.44 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.38 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.38 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.69 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.84 
 
 		 375 aa  169  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.41 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  27.84 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  27.97 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_002620  TC0347  DNA polymerase III subunit beta  30.2 
 
 		 366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.98 
 
 		 386 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  27.46 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.68 
 
 		 397 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  31.44 
 
 		 385 aa  150  4e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.8 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.76 
 
 		 385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.65 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000320383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  27.86 
 
 		 382 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.68 
 
 		 365 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.49 
 
 		 385 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.49 
 
 		 385 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.71 
 
 		 385 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.27 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  24.4 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  27.82 
 
 		 393 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  27.82 
 
 		 393 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.42 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.2 
 
 		 387 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.2 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  26.72 
 
 		 374 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.27 
 
 		 390 aa  136  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  26.98 
 
 		 372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  27.11 
 
 		 376 aa  135  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.26 
 
 		 380 aa  135  9e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  27.68 
 
 		 374 aa  132  9e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  26.15 
 
 		 367 aa  132  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  25.2 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.27 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0251  DNA polymerase III, beta subunit  32.35 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.54 
 
 		 365 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000318907  decreased coverage  0.000394754 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.53 
 
 		 360 aa  129  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000000103313  normal  1 
 
 
 
NC_011761  AFE_0001  DNA polymerase III, beta subunit  25.54 
 
 		 365 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.336764  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.66 
 
 		 370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  27.01 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.01 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00540998  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.73 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.87 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.4 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.69 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.61 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  26.61 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2720  DNA polymerase III, beta subunit  23.81 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.6 
 
 		 378 aa  123  4e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  26.18 
 
 		 394 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00020  DNA polymerase III subunit beta  29.89 
 
 		 367 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.97 
 
 		 367 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.33 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>