More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0002 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 		 366 aa  728    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  56.95 
 
 		 366 aa  434  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.86 
 
 		 370 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  40.98 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.06 
 
 		 366 aa  275  8e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.06 
 
 		 366 aa  275  8e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  38.32 
 
 		 365 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.94 
 
 		 367 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.04 
 
 		 378 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  34.31 
 
 		 377 aa  233  5e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.41 
 
 		 378 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  40.28 
 
 		 367 aa  229  8e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.19 
 
 		 379 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.19 
 
 		 379 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  36.19 
 
 		 379 aa  226  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  36.19 
 
 		 379 aa  225  8e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.19 
 
 		 379 aa  225  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  36.54 
 
 		 381 aa  225  9e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  36.54 
 
 		 381 aa  225  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.36 
 
 		 379 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.48 
 
 		 381 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  31.38 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.24 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.24 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.44 
 
 		 381 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  35.36 
 
 		 379 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.61 
 
 		 370 aa  215  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.36 
 
 		 380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  33.42 
 
 		 369 aa  200  3e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  30.85 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.38 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.28 
 
 		 374 aa  192  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.85 
 
 		 385 aa  192  7e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  33.78 
 
 		 367 aa  189  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  29.44 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.79 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  29.44 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  31.73 
 
 		 376 aa  188  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  29.6 
 
 		 378 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.36 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  29.5 
 
 		 382 aa  186  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  31.2 
 
 		 366 aa  186  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  31.87 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  30.41 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.14 
 
 		 369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  29.16 
 
 		 378 aa  182  6e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  28.88 
 
 		 378 aa  182  7e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  31.61 
 
 		 385 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  29.87 
 
 		 394 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.27 
 
 		 365 aa  182  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.7 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.35 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  28.61 
 
 		 378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  32.27 
 
 		 367 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  29.6 
 
 		 374 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  31.44 
 
 		 386 aa  179  8e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  32.12 
 
 		 385 aa  179  8e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.89 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  30.81 
 
 		 378 aa  178  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.89 
 
 		 378 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.48 
 
 		 378 aa  177  4e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  32.02 
 
 		 376 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  30.93 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.8 
 
 		 374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  31.5 
 
 		 376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  30.97 
 
 		 376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.47 
 
 		 374 aa  173  5e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  29.63 
 
 		 374 aa  173  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.76 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  29.92 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.83 
 
 		 385 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  30.71 
 
 		 376 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  30.97 
 
 		 376 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.11 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000559768  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  30.71 
 
 		 376 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  29.12 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.87 
 
 		 397 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.41 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  30.71 
 
 		 376 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  30.55 
 
 		 376 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  30.71 
 
 		 376 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  25.9 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.94 
 
 		 380 aa  163  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.22 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.87 
 
 		 372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.22 
 
 		 398 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  26.22 
 
 		 398 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.14 
 
 		 396 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0135269  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  26.53 
 
 		 398 aa  162  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.49 
 
 		 371 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000194465  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  30.18 
 
 		 376 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.97 
 
 		 376 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.12 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.12 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.93 
 
 		 373 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  26.92 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.99 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000684448  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.28 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.38 
 
 		 365 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.47 
 
 		 372 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>