More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0001 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  87.27 
 
 
385 aa  681    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 
385 aa  776    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  76.55 
 
 
388 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  64.42 
 
 
397 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  60.1 
 
 
386 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  58.81 
 
 
386 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  54.92 
 
 
385 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  53.49 
 
 
385 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  52.84 
 
 
385 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  52.84 
 
 
385 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  58.18 
 
 
390 aa  428  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  50.13 
 
 
393 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  50.13 
 
 
393 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  51.03 
 
 
382 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  49.49 
 
 
387 aa  363  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  48.48 
 
 
394 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  46.13 
 
 
374 aa  311  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0075  DNA polymerase III beta subunit family protein  32.3 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.912734 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  32.04 
 
 
376 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  34.2 
 
 
366 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.15 
 
 
365 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5506  DNA polymerase III, beta subunit  31.11 
 
 
479 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399861 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  31.54 
 
 
378 aa  197  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  31.54 
 
 
378 aa  196  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  30.77 
 
 
378 aa  195  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.59 
 
 
369 aa  192  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.85 
 
 
366 aa  192  8e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.61 
 
 
380 aa  191  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.25 
 
 
375 aa  189  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.46 
 
 
370 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  31.79 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.35 
 
 
366 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.35 
 
 
366 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  31.03 
 
 
377 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.01 
 
 
367 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  31.19 
 
 
367 aa  176  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  28.75 
 
 
374 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  27.34 
 
 
366 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  26.72 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  30.3 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.69 
 
 
372 aa  173  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  26.97 
 
 
376 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  31.03 
 
 
377 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.59 
 
 
378 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  28.97 
 
 
412 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.47 
 
 
365 aa  167  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  30.23 
 
 
377 aa  167  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.28 
 
 
373 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  26.46 
 
 
376 aa  166  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.87 
 
 
397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.27 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3705  DNA polymerase III subunit beta  30.93 
 
 
372 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0432616 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1278  DNA polymerase III subunit beta  29.46 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  2.76035e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0008  DNA polymerase III, beta subunit  46.7 
 
 
200 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  28.87 
 
 
397 aa  164  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.56 
 
 
370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.57 
 
 
379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  30 
 
 
372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.57 
 
 
379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  26.58 
 
 
376 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  27.41 
 
 
376 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.79 
 
 
377 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  26.58 
 
 
376 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.79 
 
 
377 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.38 
 
 
372 aa  162  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  27.62 
 
 
365 aa  162  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.88 
 
 
396 aa  162  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.32 
 
 
379 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  28.57 
 
 
379 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  28.32 
 
 
379 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  26.58 
 
 
376 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.14 
 
 
378 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.57 
 
 
379 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  29.38 
 
 
385 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  28.57 
 
 
379 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  26.14 
 
 
376 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  29.41 
 
 
371 aa  161  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.32 
 
 
381 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  28.42 
 
 
372 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  28.53 
 
 
376 aa  161  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.58 
 
 
370 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.88 
 
 
388 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  26.33 
 
 
376 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4592  DNA polymerase III subunit beta  28.72 
 
 
372 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0352599 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  25.63 
 
 
376 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.61 
 
 
372 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.91 
 
 
372 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  28.97 
 
 
372 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.84 
 
 
372 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  27.86 
 
 
367 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  28.32 
 
 
381 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  28.32 
 
 
381 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  29.82 
 
 
373 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  28.79 
 
 
373 aa  157  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1429  DNA polymerase III subunit beta  30.38 
 
 
375 aa  157  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.12 
 
 
367 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.06 
 
 
381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.87 
 
 
375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.03 
 
 
372 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.61 
 
 
375 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>