More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2720 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 		 376 aa  764    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  84.57 
 
 		 376 aa  656    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  93.62 
 
 		 376 aa  716    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  91.76 
 
 		 376 aa  706    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  93.09 
 
 		 376 aa  710    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  95.48 
 
 		 376 aa  732    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  93.62 
 
 		 376 aa  716    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  94.15 
 
 		 376 aa  722    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  85.11 
 
 		 376 aa  661    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  80.05 
 
 		 376 aa  619  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  41.88 
 
 		 381 aa  310  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  40.84 
 
 		 381 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  40.84 
 
 		 381 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  40.79 
 
 		 379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.79 
 
 		 379 aa  306  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.79 
 
 		 379 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  40.79 
 
 		 379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.79 
 
 		 379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.31 
 
 		 381 aa  301  9e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.26 
 
 		 379 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  40.26 
 
 		 379 aa  299  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  39.31 
 
 		 378 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.26 
 
 		 378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.04 
 
 		 377 aa  269  7e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.04 
 
 		 377 aa  269  7e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  36.77 
 
 		 377 aa  264  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.08 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.13 
 
 		 380 aa  240  4e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.66 
 
 		 374 aa  222  9e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.51 
 
 		 366 aa  216  7e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.51 
 
 		 366 aa  216  7e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  33.33 
 
 		 376 aa  213  4.9999999999999996e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.04 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  33.33 
 
 		 378 aa  206  6e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.98 
 
 		 370 aa  206  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.09 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.38 
 
 		 380 aa  203  5e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.8 
 
 		 378 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.97 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.19 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.52 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  29.52 
 
 		 366 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.68 
 
 		 365 aa  179  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.97 
 
 		 366 aa  173  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0484  DNA polymerase III, beta subunit  26.91 
 
 		 370 aa  172  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000936816  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.99 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  27.75 
 
 		 374 aa  170  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  27.44 
 
 		 366 aa  169  8e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.87 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.5 
 
 		 385 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.01 
 
 		 370 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.48 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.85 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.99 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1087  DNA polymerase III, beta subunit  27.25 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000722327  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  28.27 
 
 		 376 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  25.85 
 
 		 390 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  25.94 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  25.94 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  25.95 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  27.98 
 
 		 377 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.97 
 
 		 385 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  25.63 
 
 		 385 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  24.81 
 
 		 374 aa  156  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  27.2 
 
 		 365 aa  155  8e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.2 
 
 		 375 aa  155  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  27.46 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.75 
 
 		 376 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  26.48 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.15 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.15 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  25.9 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  25.64 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  26.27 
 
 		 382 aa  149  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  27.36 
 
 		 394 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.75 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  25.06 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  24.56 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  24.74 
 
 		 374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0002  DNA-directed DNA polymerase  28.17 
 
 		 409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  25.12 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.32 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.78 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  25.59 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03482  DNA polymerase III subunit beta  25.13 
 
 		 366 aa  145  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.3 
 
 		 373 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.7 
 
 		 375 aa  143  5e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.140323  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.01 
 
 		 375 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.01 
 
 		 375 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002008  DNA polymerase III beta subunit  23.87 
 
 		 366 aa  142  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000997729  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.47 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  25.07 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0815  DNA polymerase III, beta subunit  27.56 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000015774  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  24.4 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.99 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  28.05 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  27.27 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.07 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.52 
 
 		 373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.42 
 
 		 372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>