More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1551 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 367 aa  749    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.59 
 
 		 367 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  30.77 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.53 
 
 		 367 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.54 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  33.08 
 
 		 388 aa  186  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.37 
 
 		 378 aa  186  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  33.07 
 
 		 379 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.07 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.07 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.59 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.07 
 
 		 379 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.23 
 
 		 378 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  31.91 
 
 		 376 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.85 
 
 		 381 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  33.07 
 
 		 379 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  32.64 
 
 		 381 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  32.64 
 
 		 381 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  33.07 
 
 		 379 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.07 
 
 		 379 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.64 
 
 		 381 aa  182  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.65 
 
 		 366 aa  182  8.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.4 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.4 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.81 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.81 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.8 
 
 		 370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.27 
 
 		 366 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  31.05 
 
 		 390 aa  179  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  31.49 
 
 		 394 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  31.9 
 
 		 393 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  31.9 
 
 		 393 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  31.19 
 
 		 385 aa  176  6e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  29.49 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.03 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  31.03 
 
 		 397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.91 
 
 		 375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.61 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.18 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  31.03 
 
 		 385 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0002  DNA-directed DNA polymerase  31.58 
 
 		 409 aa  170  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.59 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  29.77 
 
 		 382 aa  169  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  30.63 
 
 		 374 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0137  DNA polymerase III subunit beta  28.27 
 
 		 366 aa  169  9e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000108126  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.33 
 
 		 385 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.08 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.92 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186277  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  29.32 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.61 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.07 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1278  DNA polymerase III subunit beta  29.4 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  2.76035e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.12 
 
 		 385 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.2 
 
 		 375 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.85 
 
 		 385 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.2 
 
 		 375 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.05 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.47 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.3 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.65 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.94 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  29.78 
 
 		 378 aa  164  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.33 
 
 		 367 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.44 
 
 		 372 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  27.22 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.97 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.3 
 
 		 367 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000485336  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.54 
 
 		 365 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.77 
 
 		 385 aa  162  7e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  31.71 
 
 		 386 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.95 
 
 		 367 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00020  DNA polymerase III subunit beta  29.95 
 
 		 367 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00020  DNA polymerase III subunit beta  30.65 
 
 		 367 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  28.95 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  27.97 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.03 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000905958  normal  0.127223 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.57 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  30.1 
 
 		 378 aa  160  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  30.87 
 
 		 370 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  30.93 
 
 		 386 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.71 
 
 		 372 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  29.47 
 
 		 378 aa  159  6e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.21 
 
 		 397 aa  159  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  29.4 
 
 		 376 aa  159  6e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  29.84 
 
 		 378 aa  159  7e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.13 
 
 		 366 aa  159  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000544098  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.18 
 
 		 374 aa  159  9e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  29.21 
 
 		 397 aa  159  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.61 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.44 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.121469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0007  DNA-directed DNA polymerase  30.65 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000118658  unclonable  0.000000000121971 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.99 
 
 		 373 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  29.21 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.99 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  29.29 
 
 		 372 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1429  DNA polymerase III subunit beta  30.18 
 
 		 375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00003  DNA polymerase III, beta subunit  30.48 
 
 		 366 aa  155  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000112219  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00443  DNA polymerase III subunit beta  28.38 
 
 		 366 aa  155  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0002  DNA polymerase III subunit beta  28.69 
 
 		 371 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.359453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>