More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0002 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  82.43 
 
 		 382 aa  658    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 		 387 aa  788    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  61.81 
 
 		 393 aa  474  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  61.81 
 
 		 393 aa  474  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  60.25 
 
 		 394 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  59.79 
 
 		 390 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  51.89 
 
 		 388 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  52.42 
 
 		 374 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  50 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  49.49 
 
 		 385 aa  363  2e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  45.73 
 
 		 386 aa  349  4e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  43.4 
 
 		 385 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  45.8 
 
 		 397 aa  346  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  44.95 
 
 		 386 aa  345  8e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  42.64 
 
 		 385 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  42.39 
 
 		 385 aa  339  4e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  41.77 
 
 		 385 aa  323  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0075  DNA polymerase III beta subunit family protein  37.69 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.912734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0008  DNA polymerase III, beta subunit  59.89 
 
 		 200 aa  223  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5506  DNA polymerase III, beta subunit  35.47 
 
 		 479 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399861 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  29.53 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.02 
 
 		 370 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  32.24 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  30.61 
 
 		 378 aa  194  3e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.38 
 
 		 366 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  30.33 
 
 		 376 aa  192  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.35 
 
 		 366 aa  192  8e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  30.1 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  30.36 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.99 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  31.55 
 
 		 377 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  30.38 
 
 		 374 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.47 
 
 		 369 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.64 
 
 		 367 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.53 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  30.65 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.19 
 
 		 377 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.19 
 
 		 377 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  30.77 
 
 		 377 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0484  DNA polymerase III, beta subunit  30.91 
 
 		 370 aa  179  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000936816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  31.06 
 
 		 381 aa  176  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.29 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.73 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.94 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.94 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.47 
 
 		 375 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.47 
 
 		 375 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.1 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  30.33 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.63 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.32 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  30.08 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  27.01 
 
 		 365 aa  168  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0347  DNA polymerase III subunit beta  27.39 
 
 		 366 aa  166  4e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3235  DNA polymerase III, beta subunit  26.85 
 
 		 374 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0867918 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.87 
 
 		 376 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.41 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.93 
 
 		 378 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.55 
 
 		 370 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.95 
 
 		 379 aa  163  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.68 
 
 		 378 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.95 
 
 		 379 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  29.95 
 
 		 379 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.95 
 
 		 379 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.54 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.7 
 
 		 381 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3720  DNA polymerase III, beta subunit  30.28 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.626306  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  29.95 
 
 		 379 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.75 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2720  DNA polymerase III, beta subunit  27.04 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  29.7 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.7 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.34 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1549  DNA polymerase III, beta subunit  27.51 
 
 		 374 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  29.37 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  29.37 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.94 
 
 		 378 aa  160  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.53 
 
 		 373 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0616  DNA polymerase III, beta subunit  28.45 
 
 		 372 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12563  DNA polymerase III, beta chain  26.98 
 
 		 362 aa  159  9e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.152259  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1278  DNA polymerase III subunit beta  28.46 
 
 		 373 aa  159  9e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  2.76035e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.43 
 
 		 372 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  27.66 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  27.81 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.23 
 
 		 372 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4880  DNA polymerase III, beta subunit  28.57 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.14 
 
 		 372 aa  157  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.14 
 
 		 372 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  26.56 
 
 		 367 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1087  DNA polymerase III, beta subunit  29.19 
 
 		 369 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000722327  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.57 
 
 		 372 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.58 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000194465  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.51 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.42 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  26.79 
 
 		 376 aa  152  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0152  DNA polymerase III subunit beta  29.34 
 
 		 372 aa  152  8e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  26.01 
 
 		 376 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  26.01 
 
 		 376 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1752  DNA polymerase III, beta subunit  25.83 
 
 		 374 aa  152  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.236146  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  26.01 
 
 		 376 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>