More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2372 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 		 366 aa  733    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  56.95 
 
 		 366 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  43.4 
 
 		 370 aa  316  4e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  39.51 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.06 
 
 		 366 aa  281  9e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.06 
 
 		 366 aa  281  9e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.7 
 
 		 365 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.24 
 
 		 367 aa  248  9e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.64 
 
 		 378 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  34.22 
 
 		 377 aa  229  6e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  36.05 
 
 		 381 aa  225  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  36.05 
 
 		 381 aa  225  9e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.11 
 
 		 378 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.76 
 
 		 367 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.79 
 
 		 381 aa  222  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.87 
 
 		 377 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.87 
 
 		 377 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.71 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  35.71 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  35.71 
 
 		 379 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.28 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.28 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.06 
 
 		 370 aa  218  8.999999999999998e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  35.28 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.28 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.65 
 
 		 381 aa  215  7e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  34.15 
 
 		 369 aa  213  5.999999999999999e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.42 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  30.75 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  31.91 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  31.17 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.6 
 
 		 390 aa  206  6e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.53 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  33.42 
 
 		 376 aa  203  5e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  29.13 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  31.37 
 
 		 374 aa  200  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  32.7 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  28.83 
 
 		 393 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  28.83 
 
 		 393 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  29.95 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.57 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  31.77 
 
 		 385 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  31.51 
 
 		 385 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.83 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.35 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.84 
 
 		 369 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.87 
 
 		 388 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0003  DNA polymerase III, beta subunit  31.35 
 
 		 368 aa  189  9e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000559768  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.55 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  30.05 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.33 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  30.57 
 
 		 386 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  30.05 
 
 		 376 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.73 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.84 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  28.99 
 
 		 376 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  28.99 
 
 		 376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  29.52 
 
 		 376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  29.26 
 
 		 376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  28.99 
 
 		 376 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  28.99 
 
 		 376 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  28.99 
 
 		 376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  28.76 
 
 		 378 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.5 
 
 		 378 aa  179  7e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.53 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.03 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.34 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.59 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  29.63 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  28.53 
 
 		 378 aa  176  6e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.99 
 
 		 375 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.99 
 
 		 375 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.34 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.18 
 
 		 371 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000194465  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  29.49 
 
 		 367 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  28.27 
 
 		 378 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  27.98 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.43 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.72 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.58 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.42 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  28.72 
 
 		 378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.42 
 
 		 372 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.95 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.54 
 
 		 373 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  28.99 
 
 		 376 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  27.35 
 
 		 372 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.49 
 
 		 372 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.91 
 
 		 397 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  27.59 
 
 		 377 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0815  DNA polymerase III, beta subunit  28.22 
 
 		 375 aa  169  7e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000015774  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.38 
 
 		 370 aa  169  9e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.88 
 
 		 372 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  26.84 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0347  DNA polymerase III subunit beta  28.65 
 
 		 366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.46 
 
 		 365 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.88 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.17 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.15 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.76 
 
 		 376 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>