More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0002 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 375 aa  746    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  98.93 
 
 		 375 aa  738    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  98.93 
 
 		 375 aa  738    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  82.76 
 
 		 376 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  43.83 
 
 		 372 aa  338  9e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  44.09 
 
 		 372 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  43.04 
 
 		 372 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  44.36 
 
 		 373 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  42.26 
 
 		 372 aa  325  9e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  40.94 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  40.94 
 
 		 372 aa  297  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  41.76 
 
 		 365 aa  295  7e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  40.58 
 
 		 373 aa  288  7e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  37.66 
 
 		 374 aa  252  8.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  37.87 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.36 
 
 		 376 aa  243  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3705  DNA polymerase III subunit beta  38.85 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0432616 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  38.38 
 
 		 385 aa  237  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2688  DNA polymerase III, beta subunit  35.11 
 
 		 369 aa  237  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0188688  hitchhiker  0.00114167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.98 
 
 		 371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000194465  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  38.38 
 
 		 397 aa  235  8e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.74 
 
 		 372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  38.87 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.22 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.474691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1278  DNA polymerase III subunit beta  37.14 
 
 		 373 aa  234  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  2.76035e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.12 
 
 		 397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.86 
 
 		 373 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2834  DNA polymerase III subunit beta  38.22 
 
 		 372 aa  232  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.7 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  38.06 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.96 
 
 		 372 aa  230  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.38 
 
 		 373 aa  230  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0966551  normal  0.572668 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3047  DNA polymerase III subunit beta  37.89 
 
 		 371 aa  229  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.579013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.08 
 
 		 373 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.12 
 
 		 372 aa  229  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.67 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366013 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  37.7 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  38.28 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.28 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.6 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  37.66 
 
 		 372 aa  228  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.65 
 
 		 372 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  37.7 
 
 		 372 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.43 
 
 		 372 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0003  DNA polymerase III subunit beta  37.73 
 
 		 372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  hitchhiker  0.00000350231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  37.76 
 
 		 373 aa  225  8e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.64 
 
 		 366 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.64 
 
 		 366 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.64 
 
 		 366 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000143129 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.64 
 
 		 366 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637071  unclonable  0.00000000000326658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  37.24 
 
 		 372 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.37 
 
 		 366 aa  225  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490932  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  37.24 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  37.01 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.11 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000472427  hitchhiker  0.00139326 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.91 
 
 		 373 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.11 
 
 		 366 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000577304  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0010  DNA polymerase III, beta subunit  35.11 
 
 		 366 aa  224  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000642144  hitchhiker  0.00000000134313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0162  DNA polymerase III subunit beta  36.22 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281652  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  37.14 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0009  DNA polymerase III, beta subunit  35.11 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0014  DNA-directed DNA polymerase  35.54 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000733559  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.84 
 
 		 366 aa  220  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000544098  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4592  DNA polymerase III subunit beta  37.24 
 
 		 372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0352599 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0002  DNA-directed DNA polymerase  36.77 
 
 		 367 aa  219  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.57 
 
 		 366 aa  219  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000136085  unclonable  0.00000000917615 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  35.53 
 
 		 370 aa  219  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1429  DNA polymerase III subunit beta  35.62 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.01 
 
 		 366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000158001  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.27 
 
 		 374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.75 
 
 		 367 aa  216  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1437  DNA polymerase III subunit beta  36.46 
 
 		 374 aa  215  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.51 
 
 		 367 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.870835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  36.72 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4118  DNA polymerase III, beta subunit  37.43 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.000107371  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.9 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000466477  normal  0.315264 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.6 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.69 
 
 		 366 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000200886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.86 
 
 		 372 aa  213  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0007  DNA-directed DNA polymerase  33.78 
 
 		 366 aa  212  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000118658  unclonable  0.000000000121971 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.75 
 
 		 372 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  34.13 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.14 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000030299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.22 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0963742  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.17 
 
 		 372 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.41 
 
 		 369 aa  209  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.83 
 
 		 372 aa  209  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00413752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.13 
 
 		 368 aa  209  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185617  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.04 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000267756  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.73 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348811  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2506  DNA polymerase III subunit beta  32.71 
 
 		 366 aa  208  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0102  DNA polymerase III subunit beta  35.05 
 
 		 367 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.57 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2236  DNA polymerase III subunit beta  35.05 
 
 		 367 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.05 
 
 		 367 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.645907  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0002  DNA polymerase III subunit beta  35.05 
 
 		 367 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.18752  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0300  DNA polymerase III subunit beta  35.05 
 
 		 367 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2849  DNA polymerase III subunit beta  35.05 
 
 		 367 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03482  DNA polymerase III subunit beta  33.33 
 
 		 366 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0088  DNA polymerase III subunit beta  35.05 
 
 		 367 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>