More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0002 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 376 aa  748    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  82.76 
 
 		 375 aa  621  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  83.02 
 
 		 375 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  82.76 
 
 		 375 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  44.76 
 
 		 372 aa  345  6e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  44.5 
 
 		 372 aa  345  6e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  42.41 
 
 		 372 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  43.72 
 
 		 373 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  42.15 
 
 		 372 aa  322  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  41.1 
 
 		 372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  40.73 
 
 		 373 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  40.73 
 
 		 372 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  42.18 
 
 		 365 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  40.87 
 
 		 372 aa  252  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  40.73 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  38.56 
 
 		 366 aa  243  6e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.15 
 
 		 376 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  39.74 
 
 		 373 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  39.02 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  38.54 
 
 		 397 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3705  DNA polymerase III subunit beta  40.21 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0432616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  36.34 
 
 		 374 aa  237  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  38.28 
 
 		 385 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.05 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  39.84 
 
 		 370 aa  237  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  39.9 
 
 		 373 aa  236  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  39.9 
 
 		 373 aa  236  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.6 
 
 		 366 aa  235  8e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000577304  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.6 
 
 		 366 aa  235  8e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000472427  hitchhiker  0.00139326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0010  DNA polymerase III, beta subunit  36.6 
 
 		 366 aa  235  8e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000642144  hitchhiker  0.00000000134313 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.28 
 
 		 397 aa  235  9e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3047  DNA polymerase III subunit beta  40 
 
 		 371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.579013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  40.05 
 
 		 373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.28 
 
 		 372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.62 
 
 		 371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000194465  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1278  DNA polymerase III subunit beta  38.08 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  2.76035e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.04 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.04 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637071  unclonable  0.00000000000326658 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.04 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.04 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000143129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.8 
 
 		 372 aa  233  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  38.96 
 
 		 373 aa  232  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.51 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490932  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0014  DNA-directed DNA polymerase  37.3 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000733559  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  38.28 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.28 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1429  DNA polymerase III subunit beta  38.4 
 
 		 375 aa  230  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.08 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0162  DNA polymerase III subunit beta  38.86 
 
 		 372 aa  230  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281652  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.04 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000158001  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.94 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000544098  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.9 
 
 		 373 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  39.32 
 
 		 373 aa  229  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0009  DNA polymerase III, beta subunit  35.98 
 
 		 366 aa  229  8e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.6 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  38.02 
 
 		 371 aa  227  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.04 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000136085  unclonable  0.00000000917615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1437  DNA polymerase III subunit beta  38.08 
 
 		 374 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.76 
 
 		 372 aa  226  6e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4592  DNA polymerase III subunit beta  38.02 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0352599 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  37.76 
 
 		 412 aa  224  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  39.53 
 
 		 372 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.34 
 
 		 372 aa  224  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.474691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0003  DNA polymerase III subunit beta  38.44 
 
 		 372 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  hitchhiker  0.00000350231 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2688  DNA polymerase III, beta subunit  33.68 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0188688  hitchhiker  0.00114167 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.5 
 
 		 366 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000466477  normal  0.315264 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0007  DNA-directed DNA polymerase  35.98 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000118658  unclonable  0.000000000121971 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  39.38 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.75 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000200886  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.54 
 
 		 373 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0966551  normal  0.572668 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2834  DNA polymerase III subunit beta  37.92 
 
 		 372 aa  219  6e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  36.46 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0002  DNA-directed DNA polymerase  36.15 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.7 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348811  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.51 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000267756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.43 
 
 		 372 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0002  DNA polymerase III subunit beta  39.16 
 
 		 372 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.54 
 
 		 365 aa  215  9e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.95 
 
 		 374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.41 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.870835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.11 
 
 		 368 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0963742  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4118  DNA polymerase III, beta subunit  36.16 
 
 		 368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.000107371  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.43 
 
 		 368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185617  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00443  DNA polymerase III subunit beta  32.01 
 
 		 366 aa  213  5.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2506  DNA polymerase III subunit beta  32.54 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0102  DNA polymerase III subunit beta  36.07 
 
 		 367 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2236  DNA polymerase III subunit beta  36.07 
 
 		 367 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2849  DNA polymerase III subunit beta  36.07 
 
 		 367 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0002  DNA polymerase III subunit beta  36.07 
 
 		 367 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.18752  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.07 
 
 		 367 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.645907  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0088  DNA polymerase III subunit beta  36.07 
 
 		 367 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0300  DNA polymerase III subunit beta  36.07 
 
 		 367 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  34.57 
 
 		 366 aa  209  7e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.53 
 
 		 381 aa  209  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000030299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.54 
 
 		 367 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.92 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00825161  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.28 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3240  DNA polymerase III subunit beta  35.81 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551286  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.7 
 
 		 366 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366013 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.53 
 
 		 368 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0232451  hitchhiker  0.0000583688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>