More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00020 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 365 aa  743    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  57.38 
 
 		 366 aa  435  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  47.4 
 
 		 365 aa  363  4e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  39.34 
 
 		 366 aa  278  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.22 
 
 		 369 aa  246  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.24 
 
 		 367 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.15 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.13 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.99 
 
 		 375 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.11 
 
 		 367 aa  199  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.27 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.27 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  30.48 
 
 		 377 aa  195  9e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.05 
 
 		 378 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  31.11 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.22 
 
 		 370 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.85 
 
 		 374 aa  192  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.59 
 
 		 374 aa  192  9e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  30.56 
 
 		 376 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  31.48 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  31.28 
 
 		 378 aa  190  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  30.75 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  30.21 
 
 		 378 aa  186  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.22 
 
 		 375 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000684448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  29.74 
 
 		 379 aa  186  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  29.74 
 
 		 379 aa  185  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.74 
 
 		 379 aa  185  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.74 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.2 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.74 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.74 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  29.74 
 
 		 379 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.08 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.41 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.41 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.84 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.47 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.68 
 
 		 398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  30.1 
 
 		 394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.68 
 
 		 398 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  28.68 
 
 		 398 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  30.79 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  29.95 
 
 		 381 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  29.95 
 
 		 381 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.27 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.24 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  30.21 
 
 		 376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.79 
 
 		 398 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  29.68 
 
 		 376 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  30.21 
 
 		 376 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.73 
 
 		 374 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  31.3 
 
 		 376 aa  179  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  30.21 
 
 		 376 aa  179  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  29.68 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.4 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.13 
 
 		 378 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  28.28 
 
 		 398 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  29.68 
 
 		 376 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  29.68 
 
 		 376 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.4 
 
 		 372 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  29.68 
 
 		 376 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.84 
 
 		 380 aa  176  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.54 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.61 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.34 
 
 		 374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.81 
 
 		 385 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0086  DNA polymerase III subunit beta  29.43 
 
 		 379 aa  173  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  27.37 
 
 		 402 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  29.58 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  28.15 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  28.42 
 
 		 382 aa  170  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.98 
 
 		 385 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.27 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  28.88 
 
 		 377 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.35 
 
 		 365 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.88 
 
 		 370 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  29.33 
 
 		 376 aa  169  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.77 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  29.62 
 
 		 366 aa  168  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.01 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.8 
 
 		 366 aa  168  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000466477  normal  0.315264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.01 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0135269  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  28.07 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  29.58 
 
 		 381 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  28.46 
 
 		 366 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  28.08 
 
 		 379 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.53 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.58 
 
 		 408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.46 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0044  DNA polymerase III, beta subunit  27.85 
 
 		 374 aa  164  3e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.05 
 
 		 385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  28.05 
 
 		 378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.73 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  27.84 
 
 		 365 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.1 
 
 		 367 aa  162  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.62 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.73 
 
 		 367 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000485336  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00020  DNA polymerase III subunit beta  29 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.79 
 
 		 378 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>