More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0002 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 387 aa  761    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  55.56 
 
 		 375 aa  425  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000684448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  54.12 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0002  DNA polymerase III subunit beta  56.7 
 
 		 378 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  55.13 
 
 		 380 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0002  DNA polymerase III, beta subunit  53.57 
 
 		 379 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000269969  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0002  DNA polymerase III subunit beta  52.07 
 
 		 408 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0003  DNA polymerase III, beta subunit  54.27 
 
 		 386 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0003  DNA polymerase III, beta subunit  52.05 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0002  DNA polymerase III, beta subunit  53.49 
 
 		 378 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0002  DNA polymerase III subunit beta  49.5 
 
 		 396 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0135269  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0002  DNA polymerase III, beta subunit  52.41 
 
 		 386 aa  378  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0086  DNA polymerase III subunit beta  50.9 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  51.14 
 
 		 388 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  51.81 
 
 		 374 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  51.3 
 
 		 374 aa  364  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  50.25 
 
 		 398 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00020  DNA polymerase III, beta subunit  50.9 
 
 		 376 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  50.25 
 
 		 398 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  50.25 
 
 		 398 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  51.79 
 
 		 377 aa  360  2e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00020  DNA polymerase III, beta subunit  49.87 
 
 		 374 aa  360  3e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218776  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  48.86 
 
 		 396 aa  359  4e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  50.13 
 
 		 398 aa  359  5e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  51.68 
 
 		 376 aa  358  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  50.13 
 
 		 376 aa  357  2.9999999999999997e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000849521  normal  0.168185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  49.37 
 
 		 398 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0002  DNA polymerase III, beta subunit  51.93 
 
 		 383 aa  342  5e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435185 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00020  DNA polymerase III, beta subunit  47.04 
 
 		 378 aa  339  4e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  47.24 
 
 		 402 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  47.16 
 
 		 408 aa  338  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5295  DNA polymerase III, beta subunit  48.99 
 
 		 384 aa  335  7e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  47.21 
 
 		 378 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00020  DNA polymerase III, beta subunit  47.93 
 
 		 374 aa  333  3e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00020  DNA polymerase III subunit beta  48.86 
 
 		 379 aa  329  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251098  normal  0.535088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0002  DNA polymerase III, beta subunit  48.84 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00244113  unclonable  0.0000000186271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0003  DNA polymerase III, beta subunit  48.59 
 
 		 377 aa  326  5e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000000000316606  hitchhiker  0.00386911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0002  DNA polymerase III subunit beta  47.93 
 
 		 380 aa  322  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000348637  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  44.3 
 
 		 365 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3544  DNA polymerase III subunit beta  43.67 
 
 		 364 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.908435  normal  0.835762 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0044  DNA polymerase III, beta subunit  37.63 
 
 		 374 aa  277  3e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1435  DNA polymerase III subunit beta  39.69 
 
 		 374 aa  275  8e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.674698  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0738  DNA polymerase III beta subunit family protein  43.47 
 
 		 433 aa  270  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5871  DNA polymerase III, beta subunit  42.38 
 
 		 404 aa  266  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  31.62 
 
 		 365 aa  178  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.46 
 
 		 366 aa  166  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.46 
 
 		 366 aa  166  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.67 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.9 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.21 
 
 		 365 aa  154  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.06 
 
 		 366 aa  149  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.79 
 
 		 365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  24.74 
 
 		 366 aa  146  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.44 
 
 		 369 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.6 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.38 
 
 		 370 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.87 
 
 		 385 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  27.69 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.49 
 
 		 385 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25 
 
 		 380 aa  136  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  27.69 
 
 		 378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  27.15 
 
 		 378 aa  135  8e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.89 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0815  DNA polymerase III, beta subunit  27.97 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000015774  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  29.02 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.14 
 
 		 385 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0662  DNA polymerase III, beta subunit  24.68 
 
 		 366 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000326321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0686  DNA polymerase III, beta subunit  25.19 
 
 		 366 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0347365  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.61 
 
 		 378 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  26.79 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  27.78 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  27.78 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  26.55 
 
 		 381 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  26.55 
 
 		 381 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.94 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.88 
 
 		 373 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.94 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.05 
 
 		 381 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  25.94 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  27.06 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  26.79 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.8 
 
 		 381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  26.02 
 
 		 367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  25.94 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.94 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.93 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  24.94 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.12 
 
 		 379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  26.12 
 
 		 379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  25.56 
 
 		 376 aa  126  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.96 
 
 		 367 aa  126  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  27.2 
 
 		 376 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  26.11 
 
 		 376 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  27.86 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.29 
 
 		 370 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  26.53 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  25 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  26.53 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.13 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.13 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>