More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0002 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  89.65 
 
 		 398 aa  694    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  89.65 
 
 		 398 aa  693    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  89.65 
 
 		 398 aa  693    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 		 398 aa  778    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  95.23 
 
 		 398 aa  728    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  79.6 
 
 		 402 aa  622  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  68.09 
 
 		 396 aa  542  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  66.84 
 
 		 388 aa  506  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  58.52 
 
 		 378 aa  431  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00020  DNA polymerase III subunit beta  60.41 
 
 		 379 aa  413  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251098  normal  0.535088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  53.7 
 
 		 408 aa  403  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0002  DNA polymerase III, beta subunit  56.01 
 
 		 386 aa  398  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  53.61 
 
 		 379 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  52.45 
 
 		 375 aa  378  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000684448  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0002  DNA polymerase III subunit beta  52.82 
 
 		 378 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0002  DNA polymerase III subunit beta  50.64 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  50.64 
 
 		 380 aa  364  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0002  DNA polymerase III subunit beta  47.9 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0135269  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0002  DNA polymerase III, beta subunit  50.64 
 
 		 379 aa  355  7.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000269969  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0086  DNA polymerase III subunit beta  48.07 
 
 		 379 aa  350  3e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  48.19 
 
 		 376 aa  350  4e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  49.37 
 
 		 387 aa  346  4e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  47.04 
 
 		 377 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  45.99 
 
 		 374 aa  343  4e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00020  DNA polymerase III, beta subunit  46.63 
 
 		 376 aa  342  9e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0002  DNA polymerase III, beta subunit  47.42 
 
 		 378 aa  340  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0003  DNA polymerase III, beta subunit  46.38 
 
 		 402 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  45.99 
 
 		 374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0002  DNA polymerase III, beta subunit  49.1 
 
 		 377 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00244113  unclonable  0.0000000186271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0002  DNA polymerase III subunit beta  47.56 
 
 		 380 aa  335  7.999999999999999e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000348637  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  45.34 
 
 		 376 aa  333  3e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000849521  normal  0.168185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0003  DNA polymerase III, beta subunit  48.58 
 
 		 377 aa  332  6e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000000000316606  hitchhiker  0.00386911 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0002  DNA polymerase III, beta subunit  49.18 
 
 		 383 aa  332  9e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435185 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00020  DNA polymerase III, beta subunit  45.85 
 
 		 374 aa  330  2e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  46.23 
 
 		 365 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0003  DNA polymerase III, beta subunit  48.25 
 
 		 386 aa  323  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00020  DNA polymerase III, beta subunit  43.9 
 
 		 374 aa  322  8e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00020  DNA polymerase III, beta subunit  44.59 
 
 		 378 aa  317  2e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5295  DNA polymerase III, beta subunit  44.81 
 
 		 384 aa  305  8.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3544  DNA polymerase III subunit beta  42.71 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.908435  normal  0.835762 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1435  DNA polymerase III subunit beta  37.66 
 
 		 374 aa  262  6.999999999999999e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.674698  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0044  DNA polymerase III, beta subunit  34.55 
 
 		 374 aa  251  2e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5871  DNA polymerase III, beta subunit  39.38 
 
 		 404 aa  236  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0738  DNA polymerase III beta subunit family protein  37.59 
 
 		 433 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.69 
 
 		 369 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.05 
 
 		 365 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.12 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.23 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.79 
 
 		 365 aa  180  4e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.76 
 
 		 378 aa  176  8e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.13 
 
 		 378 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.52 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.52 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.59 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.41 
 
 		 366 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.61 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.61 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  27.53 
 
 		 376 aa  166  8e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.93 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.89 
 
 		 385 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.5 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.89 
 
 		 397 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.93 
 
 		 385 aa  159  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  28.43 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  27.08 
 
 		 379 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0251  DNA polymerase III, beta subunit  34.46 
 
 		 365 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  25.64 
 
 		 366 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.88 
 
 		 380 aa  158  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.47 
 
 		 381 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0686  DNA polymerase III, beta subunit  26.57 
 
 		 366 aa  157  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0347365  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.81 
 
 		 379 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.81 
 
 		 379 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.08 
 
 		 379 aa  156  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  27.08 
 
 		 379 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.66 
 
 		 388 aa  156  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.67 
 
 		 381 aa  156  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  27.47 
 
 		 381 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.61 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  27.78 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.61 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  27.47 
 
 		 381 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  26.54 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.54 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.62 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.82 
 
 		 376 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  28.35 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.45 
 
 		 366 aa  152  7e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  25.9 
 
 		 367 aa  152  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  28.39 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  26.54 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.33 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0662  DNA polymerase III, beta subunit  26.07 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000326321  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.15 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.39 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.27 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  27.45 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.14 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000000103313  normal  1 
 
 
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.62 
 
 		 370 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.4 
 
 		 372 aa  150  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.73 
 
 		 375 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>