More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0002 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 374 aa  748    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  94.65 
 
 		 374 aa  716    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00020  DNA polymerase III, beta subunit  65.59 
 
 		 374 aa  482  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00020  DNA polymerase III, beta subunit  61.5 
 
 		 376 aa  465  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  61.76 
 
 		 376 aa  467  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  63.73 
 
 		 377 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  60.64 
 
 		 376 aa  459  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000849521  normal  0.168185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0002  DNA polymerase III, beta subunit  60.37 
 
 		 378 aa  450  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0002  DNA polymerase III, beta subunit  59.79 
 
 		 383 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435185 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00020  DNA polymerase III, beta subunit  51.6 
 
 		 374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218776  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.7 
 
 		 408 aa  396  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00020  DNA polymerase III, beta subunit  52.52 
 
 		 378 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  55.38 
 
 		 380 aa  388  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0002  DNA polymerase III subunit beta  50.51 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0135269  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  54.13 
 
 		 375 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000684448  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0002  DNA polymerase III, beta subunit  54.71 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000269969  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  51.19 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0002  DNA polymerase III subunit beta  52.39 
 
 		 378 aa  362  9e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  51.81 
 
 		 387 aa  361  1e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  48.33 
 
 		 388 aa  344  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  50 
 
 		 378 aa  343  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1435  DNA polymerase III subunit beta  44.92 
 
 		 374 aa  342  5.999999999999999e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.674698  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0002  DNA polymerase III, beta subunit  46.89 
 
 		 386 aa  342  7e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  47.29 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0086  DNA polymerase III subunit beta  47.11 
 
 		 379 aa  338  7e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0003  DNA polymerase III, beta subunit  47.63 
 
 		 402 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  45.99 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0003  DNA polymerase III, beta subunit  49.47 
 
 		 377 aa  335  7e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000000000316606  hitchhiker  0.00386911 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0044  DNA polymerase III, beta subunit  41.18 
 
 		 374 aa  335  9e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  45.5 
 
 		 408 aa  329  6e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0002  DNA polymerase III, beta subunit  48.94 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00244113  unclonable  0.0000000186271 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  45.74 
 
 		 398 aa  328  9e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  46.51 
 
 		 365 aa  327  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  44.04 
 
 		 398 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  43.85 
 
 		 402 aa  323  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  44.04 
 
 		 398 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  44.04 
 
 		 398 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0003  DNA polymerase III, beta subunit  46.88 
 
 		 386 aa  323  4e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00020  DNA polymerase III subunit beta  48.42 
 
 		 379 aa  309  6.999999999999999e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251098  normal  0.535088 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5295  DNA polymerase III, beta subunit  45.31 
 
 		 384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0002  DNA polymerase III subunit beta  45.77 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000348637  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3544  DNA polymerase III subunit beta  45.55 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.908435  normal  0.835762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5871  DNA polymerase III, beta subunit  37.68 
 
 		 404 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0738  DNA polymerase III beta subunit family protein  37.06 
 
 		 433 aa  232  7.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.72 
 
 		 375 aa  202  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.59 
 
 		 365 aa  192  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.56 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.33 
 
 		 366 aa  179  7e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.4 
 
 		 365 aa  176  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.38 
 
 		 366 aa  173  5e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.88 
 
 		 365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.66 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.66 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.67 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.24 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  28.84 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.42 
 
 		 378 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.65 
 
 		 379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.65 
 
 		 379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  25.65 
 
 		 379 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  28.32 
 
 		 385 aa  156  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  25.65 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.65 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.65 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.64 
 
 		 380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  25.65 
 
 		 379 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0662  DNA polymerase III, beta subunit  26.4 
 
 		 366 aa  153  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000326321  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0251  DNA polymerase III, beta subunit  34.15 
 
 		 365 aa  153  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0686  DNA polymerase III, beta subunit  26.13 
 
 		 366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0347365  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.97 
 
 		 389 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0815  DNA polymerase III, beta subunit  28.53 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000015774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.52 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0231  DNA polymerase III, beta subunit  26.13 
 
 		 367 aa  150  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000874025  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.39 
 
 		 377 aa  149  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.39 
 
 		 377 aa  149  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  27.39 
 
 		 377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  25.77 
 
 		 381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  25.77 
 
 		 381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.18 
 
 		 385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.52 
 
 		 381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.18 
 
 		 385 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.42 
 
 		 378 aa  145  8.000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  26.3 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  26.25 
 
 		 378 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  27.86 
 
 		 374 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1009  DNA polymerase III, beta subunit  28.79 
 
 		 369 aa  142  7e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.41 
 
 		 397 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.76 
 
 		 385 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3032  DNA polymerase III, beta subunit  28.19 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  25.98 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.08 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.870835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0002  DNA-directed DNA polymerase  25.46 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  25.98 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  26.68 
 
 		 374 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.44 
 
 		 367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.24 
 
 		 376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.01 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.33 
 
 		 366 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.04 
 
 		 366 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000143129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.04 
 
 		 366 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>