More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0993 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 376 aa  759    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  50 
 
 		 378 aa  375  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  49.73 
 
 		 378 aa  373  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  48.4 
 
 		 378 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  44.3 
 
 		 378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  44.83 
 
 		 377 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  43.05 
 
 		 377 aa  330  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  40.53 
 
 		 381 aa  316  4e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.63 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.64 
 
 		 367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.33 
 
 		 370 aa  236  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.38 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  32.04 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.06 
 
 		 377 aa  219  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.06 
 
 		 377 aa  219  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  33.86 
 
 		 390 aa  219  7e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  31.57 
 
 		 394 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  31.96 
 
 		 377 aa  216  7e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  33.5 
 
 		 388 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.33 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.75 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.75 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  32.65 
 
 		 386 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  32.65 
 
 		 386 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  30.75 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  32.3 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  32.04 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  30.98 
 
 		 393 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  30.98 
 
 		 393 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  31.5 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.77 
 
 		 378 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.93 
 
 		 369 aa  201  9.999999999999999e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.59 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  29.95 
 
 		 374 aa  199  7.999999999999999e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  29.87 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.15 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.49 
 
 		 381 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.87 
 
 		 379 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.61 
 
 		 379 aa  195  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.61 
 
 		 379 aa  195  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  29.87 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  30.23 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  30.23 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  29.61 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.91 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.61 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.15 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.61 
 
 		 374 aa  193  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.33 
 
 		 387 aa  192  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.56 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.46 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.67 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  32.22 
 
 		 382 aa  190  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  32.64 
 
 		 366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.11 
 
 		 372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.37 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.76 
 
 		 375 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.63 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.5 
 
 		 375 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.5 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.24 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.74 
 
 		 373 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.68 
 
 		 367 aa  186  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  31.02 
 
 		 366 aa  186  8e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0002  DNA polymerase III subunit beta  31.64 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.359453  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  31.84 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.87 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.58 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.58 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.93 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.13 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  31.91 
 
 		 367 aa  184  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.53 
 
 		 365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.73 
 
 		 376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.44 
 
 		 367 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201514  hitchhiker  0.00206466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.4 
 
 		 367 aa  182  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000905958  normal  0.127223 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2506  DNA polymerase III subunit beta  31.2 
 
 		 366 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000126636  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  31.84 
 
 		 373 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4461  DNA polymerase III subunit beta  30.89 
 
 		 367 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0591962  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.89 
 
 		 367 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  30 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.84 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  31.84 
 
 		 373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.37 
 
 		 372 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  30 
 
 		 397 aa  180  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.74 
 
 		 372 aa  180  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0002  DNA-directed DNA polymerase  30.67 
 
 		 367 aa  179  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  30 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.74 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  29.74 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  30.53 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  30.18 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.74 
 
 		 372 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002008  DNA polymerase III beta subunit  29.41 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000997729  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  31.05 
 
 		 412 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4118  DNA polymerase III, beta subunit  30.29 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.000107371  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.68 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185617  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00443  DNA polymerase III subunit beta  29.95 
 
 		 366 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3240  DNA polymerase III subunit beta  30.91 
 
 		 367 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551286  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  30.18 
 
 		 372 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>