More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1328 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 		 386 aa  773    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  97.15 
 
 		 386 aa  755    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  62.11 
 
 		 388 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  63.66 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  58.81 
 
 		 385 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  58.29 
 
 		 385 aa  481  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  54.24 
 
 		 385 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  54.55 
 
 		 385 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  54.92 
 
 		 385 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  54.1 
 
 		 385 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  47.93 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  46.17 
 
 		 382 aa  355  5.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  47.19 
 
 		 393 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  47.19 
 
 		 393 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  45.73 
 
 		 387 aa  349  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  45.06 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  42.82 
 
 		 374 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0075  DNA polymerase III beta subunit family protein  34.02 
 
 		 444 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.912734 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  32.65 
 
 		 376 aa  213  7e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  30.61 
 
 		 378 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  30.36 
 
 		 378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  30.1 
 
 		 378 aa  196  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.47 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  30.63 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5506  DNA polymerase III, beta subunit  29.74 
 
 		 479 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399861 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.9 
 
 		 380 aa  187  4e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  30.57 
 
 		 366 aa  186  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  30.03 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.83 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  29.77 
 
 		 377 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.69 
 
 		 366 aa  182  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  29.77 
 
 		 378 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.79 
 
 		 369 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  28.83 
 
 		 374 aa  176  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.93 
 
 		 366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.12 
 
 		 365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.79 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.79 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.49 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  30.79 
 
 		 379 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  30.79 
 
 		 379 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.79 
 
 		 379 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.79 
 
 		 379 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  31.04 
 
 		 379 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.09 
 
 		 366 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.09 
 
 		 366 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.01 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.03 
 
 		 367 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  30.96 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.27 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  30.96 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.68 
 
 		 378 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.46 
 
 		 381 aa  166  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.35 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.96 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.21 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.35 
 
 		 372 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.98 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0008  DNA polymerase III, beta subunit  44.51 
 
 		 200 aa  163  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.84 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.35 
 
 		 372 aa  163  6e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.52 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.84 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.52 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.19 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  30.71 
 
 		 377 aa  160  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  29.47 
 
 		 376 aa  159  5e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  30.93 
 
 		 367 aa  159  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  29.2 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3235  DNA polymerase III, beta subunit  28.21 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0867918 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.51 
 
 		 375 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.99 
 
 		 375 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  27.32 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.83 
 
 		 369 aa  158  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.31 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.25 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.35 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.65 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  27.18 
 
 		 372 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  28.13 
 
 		 372 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  26.3 
 
 		 366 aa  153  5.9999999999999996e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.78 
 
 		 376 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  26.82 
 
 		 365 aa  151  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.09 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  27.06 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  27.06 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.46 
 
 		 380 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.45 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.44 
 
 		 372 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  27.46 
 
 		 365 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.53 
 
 		 367 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  27.58 
 
 		 365 aa  149  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.9 
 
 		 372 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.55 
 
 		 372 aa  149  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.474691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  27.45 
 
 		 398 aa  149  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.82 
 
 		 374 aa  149  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3720  DNA polymerase III, beta subunit  30.38 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.626306  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  26.48 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0003  DNA polymerase III subunit beta  27.32 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  hitchhiker  0.00000350231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.85 
 
 		 398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>