More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5506 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5506  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 479 aa  964    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399861 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  35.95 
 
 		 382 aa  228  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.47 
 
 		 387 aa  219  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  32.41 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  32.41 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  31.62 
 
 		 385 aa  210  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.71 
 
 		 388 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  31.71 
 
 		 385 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  31.36 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  32.99 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  32.74 
 
 		 397 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  31.11 
 
 		 385 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  32.49 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.51 
 
 		 386 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.33 
 
 		 385 aa  192  9e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  29.74 
 
 		 386 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  30.75 
 
 		 374 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.41 
 
 		 385 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  29.27 
 
 		 376 aa  160  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0075  DNA polymerase III beta subunit family protein  28.85 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.912734 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.37 
 
 		 366 aa  146  9e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.65 
 
 		 375 aa  144  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.23 
 
 		 365 aa  144  4e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  25.96 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.18 
 
 		 375 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  27.42 
 
 		 378 aa  140  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.41 
 
 		 369 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.92 
 
 		 375 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.92 
 
 		 375 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  27.47 
 
 		 378 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  28 
 
 		 378 aa  139  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  26.37 
 
 		 367 aa  137  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  26.45 
 
 		 366 aa  137  5e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.59 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.75 
 
 		 367 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  26.29 
 
 		 377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.58 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  26.29 
 
 		 377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  26.46 
 
 		 372 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.77 
 
 		 372 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.94 
 
 		 378 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.77 
 
 		 376 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  22.68 
 
 		 366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.52 
 
 		 372 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.75 
 
 		 373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.75 
 
 		 365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.26 
 
 		 372 aa  127  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  23.99 
 
 		 378 aa  127  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  27.14 
 
 		 381 aa  126  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.77 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.35 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  25.14 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  23.77 
 
 		 365 aa  124  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  25 
 
 		 373 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  26.54 
 
 		 376 aa  123  6e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.47 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0963  DNA polymerase III, beta subunit  26.8 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.245361  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.47 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  27.08 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  27.08 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.29 
 
 		 388 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.74 
 
 		 372 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  25.26 
 
 		 377 aa  121  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.64 
 
 		 370 aa  121  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.26 
 
 		 372 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.08 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.4 
 
 		 378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.61 
 
 		 372 aa  120  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  24.66 
 
 		 398 aa  120  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  24.81 
 
 		 376 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.32 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.81 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  26.81 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.81 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  24.56 
 
 		 376 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3235  DNA polymerase III, beta subunit  24.3 
 
 		 374 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0867918 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.91 
 
 		 372 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.52 
 
 		 378 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.04 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  26.81 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0616  DNA polymerase III, beta subunit  24.52 
 
 		 372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.81 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.27 
 
 		 372 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.05 
 
 		 366 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.05 
 
 		 366 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.81 
 
 		 379 aa  117  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  26.81 
 
 		 379 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.74 
 
 		 375 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000684448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.09 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0152  DNA polymerase III subunit beta  25 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.47 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.55 
 
 		 373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.47 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  24.42 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.03 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1549  DNA polymerase III, beta subunit  23.06 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  26.17 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  25.07 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.66 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.72 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>