More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0152 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0152  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 
372 aa  755    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1549  DNA polymerase III, beta subunit  52.96 
 
 
374 aa  416  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15445  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3235  DNA polymerase III, beta subunit  51.34 
 
 
374 aa  396  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0867918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3720  DNA polymerase III, beta subunit  48.92 
 
 
374 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.626306  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4880  DNA polymerase III, beta subunit  47.35 
 
 
379 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12563  DNA polymerase III, beta chain  43.37 
 
 
362 aa  330  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.152259  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2720  DNA polymerase III, beta subunit  42.36 
 
 
372 aa  330  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0616  DNA polymerase III, beta subunit  41.27 
 
 
372 aa  315  8e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1752  DNA polymerase III, beta subunit  42.36 
 
 
374 aa  315  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.236146  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  40.21 
 
 
379 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1853  DNA polymerase III, beta subunit  32.09 
 
 
377 aa  233  5e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.25 
 
 
372 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3715  DNA polymerase III, beta subunit  32.62 
 
 
367 aa  178  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.348294  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.3 
 
 
365 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.32 
 
 
367 aa  176  7e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186277  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.87 
 
 
375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.87 
 
 
375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.95 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000905958  normal  0.127223 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.61 
 
 
375 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00003  DNA polymerase III, beta subunit  30.29 
 
 
366 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000112219  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.73 
 
 
366 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000544098  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.96 
 
 
366 aa  170  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.366013 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00443  DNA polymerase III subunit beta  29.84 
 
 
366 aa  169  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.14 
 
 
366 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000466477  normal  0.315264 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.1 
 
 
366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.1 
 
 
366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637071  unclonable  0.00000000000326658 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.28 
 
 
367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.870835  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.71 
 
 
376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.1 
 
 
366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000143129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.1 
 
 
366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002008  DNA polymerase III beta subunit  29.57 
 
 
366 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000997729  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.14 
 
 
371 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000194465  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  28.42 
 
 
366 aa  166  9e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.76 
 
 
366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348811  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.1 
 
 
366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490932  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.48 
 
 
366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000267756  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.42 
 
 
367 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000485336  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.39 
 
 
366 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.16 
 
 
375 aa  161  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.22 
 
 
367 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.64 
 
 
388 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.18 
 
 
366 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000158001  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.37 
 
 
374 aa  159  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03482  DNA polymerase III subunit beta  29.07 
 
 
366 aa  159  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0010  DNA polymerase III subunit beta  29.1 
 
 
369 aa  159  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000914164  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  30.59 
 
 
371 aa  159  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.73 
 
 
367 aa  159  9e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  27.96 
 
 
394 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2834  DNA polymerase III subunit beta  30.34 
 
 
372 aa  159  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0009  DNA polymerase III, beta subunit  30.29 
 
 
366 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2506  DNA polymerase III subunit beta  28.49 
 
 
366 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000126636  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.12 
 
 
366 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00825161  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.84 
 
 
366 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000136085  unclonable  0.00000000917615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0002  DNA-directed DNA polymerase  28.8 
 
 
367 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.76 
 
 
366 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000577304  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0010  DNA polymerase III, beta subunit  29.76 
 
 
366 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000642144  hitchhiker  0.00000000134313 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.42 
 
 
374 aa  157  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.22496  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0137  DNA polymerase III subunit beta  28.23 
 
 
366 aa  157  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000108126  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.76 
 
 
366 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000472427  hitchhiker  0.00139326 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.51 
 
 
369 aa  157  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.16 
 
 
372 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.16 
 
 
372 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.14 
 
 
366 aa  157  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000200886  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0014  DNA-directed DNA polymerase  30.29 
 
 
366 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000733559  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00020  DNA polymerase III subunit beta  29.41 
 
 
367 aa  156  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4118  DNA polymerase III, beta subunit  30.35 
 
 
368 aa  156  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.000107371  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.18 
 
 
365 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  29.44 
 
 
372 aa  156  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.83 
 
 
368 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185617  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.12 
 
 
368 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0963742  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.88 
 
 
367 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.34 
 
 
367 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396971  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.72 
 
 
367 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000744787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.53 
 
 
366 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000790466  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.33 
 
 
367 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.121469  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0002  DNA polymerase III subunit beta  28.07 
 
 
371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.359453  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.47 
 
 
375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  29.68 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.34 
 
 
367 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.1 
 
 
372 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0007  DNA-directed DNA polymerase  30.03 
 
 
366 aa  153  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000118658  unclonable  0.000000000121971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0011  DNA polymerase III subunit beta  28.8 
 
 
367 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12322  hitchhiker  0.00002839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.8 
 
 
367 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123405  normal  0.0743731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4171  DNA polymerase III subunit beta  28.12 
 
 
366 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.264257  normal  0.345578 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4122  DNA polymerase III subunit beta  28.12 
 
 
366 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.22 
 
 
372 aa  153  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03584  DNA polymerase III subunit beta  28.2 
 
 
366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.120571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.2 
 
 
366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000276402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5129  DNA polymerase III subunit beta  28.2 
 
 
366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000402669  normal  0.135624 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3914  DNA polymerase III subunit beta  28.2 
 
 
366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000199842  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.73 
 
 
372 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4224  DNA polymerase III subunit beta  28.2 
 
 
366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000133889  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  27.34 
 
 
393 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4211  DNA polymerase III subunit beta  28.2 
 
 
366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000853421  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  27.34 
 
 
393 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4066  DNA polymerase III subunit beta  28.2 
 
 
366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0145467  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03528  hypothetical protein  28.2 
 
 
366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0779462  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.2 
 
 
366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0647653  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4152  DNA polymerase III subunit beta  29.53 
 
 
366 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517824  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4229  DNA polymerase III subunit beta  28.12 
 
 
366 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>