More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0002 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  83.86 
 
 		 378 aa  654    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 		 378 aa  768    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  72.3 
 
 		 379 aa  554  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  72.3 
 
 		 379 aa  554  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  72.3 
 
 		 379 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  72.03 
 
 		 379 aa  554  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  71.39 
 
 		 381 aa  553  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  72.3 
 
 		 379 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  71.39 
 
 		 381 aa  553  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  70.87 
 
 		 381 aa  552  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  71.39 
 
 		 381 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  71.77 
 
 		 379 aa  547  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  71.5 
 
 		 379 aa  545  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  51.59 
 
 		 377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  52.12 
 
 		 377 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  52.12 
 
 		 377 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  47.77 
 
 		 380 aa  342  8e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  45.79 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  45.03 
 
 		 378 aa  309  4e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  39.58 
 
 		 376 aa  301  9e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  38.79 
 
 		 376 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  38.52 
 
 		 376 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  38.52 
 
 		 376 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  38.52 
 
 		 376 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  37.99 
 
 		 376 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  38.26 
 
 		 376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  38.52 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  38.52 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  38.26 
 
 		 376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  40.53 
 
 		 374 aa  271  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.68 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.93 
 
 		 365 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.37 
 
 		 374 aa  258  9e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.39 
 
 		 380 aa  258  1e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  36.94 
 
 		 378 aa  257  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.17 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.17 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.53 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.51 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.55 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.41 
 
 		 366 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  35.11 
 
 		 366 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  31.33 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.51 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.46 
 
 		 372 aa  206  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.06 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  31.48 
 
 		 366 aa  202  6e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.81 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  31.85 
 
 		 374 aa  196  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.67 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.63 
 
 		 367 aa  188  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  29.46 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.38 
 
 		 373 aa  186  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  31.23 
 
 		 367 aa  183  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  29.17 
 
 		 378 aa  182  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  32.55 
 
 		 373 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.95 
 
 		 369 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  29.17 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0003  DNA polymerase III subunit beta  32.64 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  hitchhiker  0.00000350231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.29 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  30.71 
 
 		 370 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  28.39 
 
 		 378 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  29.06 
 
 		 372 aa  179  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  32.11 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  32.11 
 
 		 372 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.13 
 
 		 365 aa  178  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  32.03 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.03 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  31.77 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  28.8 
 
 		 372 aa  176  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.46 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.29 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.58 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.03 
 
 		 375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.84 
 
 		 372 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.31 
 
 		 366 aa  172  7.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.35 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.13 
 
 		 398 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.84 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  29.84 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.49 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  31.17 
 
 		 393 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  31.17 
 
 		 393 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  31.15 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.99 
 
 		 366 aa  170  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000466477  normal  0.315264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.65 
 
 		 373 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.59 
 
 		 385 aa  169  5e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.75 
 
 		 372 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.5 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.79 
 
 		 385 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.23 
 
 		 372 aa  169  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.26 
 
 		 386 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  29.01 
 
 		 386 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.8 
 
 		 372 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.5 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4592  DNA polymerase III subunit beta  30.89 
 
 		 372 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0352599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  27.08 
 
 		 377 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.52 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.63 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  29.84 
 
 		 372 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>