More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1513 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 381 aa  761    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  53.68 
 
 		 377 aa  418  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  52.37 
 
 		 377 aa  413  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  47.51 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  40.53 
 
 		 376 aa  316  4e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  38.32 
 
 		 378 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  38.22 
 
 		 378 aa  297  2e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  37.7 
 
 		 378 aa  295  6e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.61 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.61 
 
 		 370 aa  194  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  33.07 
 
 		 390 aa  190  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.08 
 
 		 367 aa  186  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  30.03 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.87 
 
 		 386 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.08 
 
 		 397 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  31.23 
 
 		 365 aa  176  5e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  31.27 
 
 		 366 aa  176  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.06 
 
 		 387 aa  176  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.3 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  27.98 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  29.46 
 
 		 394 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.72 
 
 		 385 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.05 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.05 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  28.53 
 
 		 382 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.41 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  29.26 
 
 		 381 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  29.26 
 
 		 381 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  31.6 
 
 		 393 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  31.6 
 
 		 393 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  28.39 
 
 		 379 aa  169  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.54 
 
 		 377 aa  169  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.54 
 
 		 377 aa  169  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.97 
 
 		 385 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.52 
 
 		 385 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.24 
 
 		 381 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  28.39 
 
 		 379 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.39 
 
 		 379 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.13 
 
 		 379 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.24 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.12 
 
 		 366 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.21 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.13 
 
 		 379 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  28.13 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.13 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.15 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.58 
 
 		 365 aa  166  5e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  28.18 
 
 		 377 aa  164  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  28.53 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.99 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.05 
 
 		 367 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.99 
 
 		 378 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  26.05 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.83 
 
 		 366 aa  157  4e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.3 
 
 		 367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.870835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.7 
 
 		 369 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  27.69 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3235  DNA polymerase III, beta subunit  26.94 
 
 		 374 aa  152  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0867918 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.21 
 
 		 366 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.21 
 
 		 366 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.58 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  28.68 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  27.15 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  27.11 
 
 		 396 aa  149  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  28.68 
 
 		 366 aa  149  8e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  26.37 
 
 		 367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.15 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.19 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.14 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.75 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.49 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.68 
 
 		 367 aa  146  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000905958  normal  0.127223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.5 
 
 		 374 aa  146  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.57 
 
 		 365 aa  146  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.32 
 
 		 372 aa  145  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  26.85 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12563  DNA polymerase III, beta chain  27.13 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.152259  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.61 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.03 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.68 
 
 		 367 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186277  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4118  DNA polymerase III, beta subunit  29.3 
 
 		 368 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.000107371  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0011  DNA polymerase III subunit beta  29.79 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12322  hitchhiker  0.00002839 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0231  DNA polymerase III, beta subunit  24.54 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000874025  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0002  DNA polymerase III subunit beta  28 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.32 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4461  DNA polymerase III subunit beta  28 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0591962  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.79 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123405  normal  0.0743731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.17 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185617  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.02 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.05 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.121469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.02 
 
 		 371 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0290452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.63 
 
 		 372 aa  144  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0004  DNA polymerase III subunit beta  29.87 
 
 		 367 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.32 
 
 		 378 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  25.71 
 
 		 412 aa  143  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  27.79 
 
 		 372 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.42 
 
 		 373 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3441  DNA polymerase III subunit beta  28.76 
 
 		 371 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.325472  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  27.53 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.91 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>