More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0003 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 366 aa  741    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  57.38 
 
 		 365 aa  435  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  49.18 
 
 		 365 aa  394  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  39.62 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.4 
 
 		 369 aa  249  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.69 
 
 		 375 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.97 
 
 		 365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  32.15 
 
 		 367 aa  228  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.61 
 
 		 367 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.79 
 
 		 366 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.79 
 
 		 366 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.54 
 
 		 380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  33.33 
 
 		 385 aa  209  9e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  33.59 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  34.2 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  33.33 
 
 		 385 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  34.2 
 
 		 385 aa  205  8e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.55 
 
 		 370 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  29.6 
 
 		 377 aa  202  7e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  32.64 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.4 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.67 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.29 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.51 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.6 
 
 		 377 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.6 
 
 		 377 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.28 
 
 		 375 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000684448  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  31.13 
 
 		 374 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  32.38 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.81 
 
 		 370 aa  193  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  31.02 
 
 		 378 aa  193  4e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.35 
 
 		 387 aa  192  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0086  DNA polymerase III subunit beta  33.77 
 
 		 379 aa  192  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.56 
 
 		 390 aa  191  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.77 
 
 		 388 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  32.64 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  29.77 
 
 		 382 aa  190  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  31.02 
 
 		 378 aa  190  4e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  31.44 
 
 		 365 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  31.02 
 
 		 378 aa  189  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  30.18 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.52 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  32.29 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.75 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.47 
 
 		 381 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  30 
 
 		 379 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  30 
 
 		 379 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  30 
 
 		 379 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  30 
 
 		 379 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  30 
 
 		 379 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.2 
 
 		 366 aa  186  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.32 
 
 		 370 aa  186  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  30 
 
 		 379 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  30.95 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  30 
 
 		 379 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.69 
 
 		 386 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.49 
 
 		 398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  30.95 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  28.73 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  30.49 
 
 		 398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  29.85 
 
 		 394 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  29.69 
 
 		 386 aa  182  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  28.65 
 
 		 367 aa  182  8.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.1 
 
 		 378 aa  182  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  29.06 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  29.06 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.12 
 
 		 398 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  30.32 
 
 		 376 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.33 
 
 		 374 aa  179  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.06 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  29.6 
 
 		 378 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.61 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  29.87 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  30.75 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  29.52 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  30.32 
 
 		 377 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  27.6 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.76 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5295  DNA polymerase III, beta subunit  31.52 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.62 
 
 		 367 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.03 
 
 		 369 aa  177  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3544  DNA polymerase III subunit beta  32.15 
 
 		 364 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.908435  normal  0.835762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  31.27 
 
 		 381 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.59 
 
 		 372 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  27.96 
 
 		 374 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  30.32 
 
 		 376 aa  176  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00020  DNA polymerase III subunit beta  33.07 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251098  normal  0.535088 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.33 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0231  DNA polymerase III, beta subunit  27.87 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000874025  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  28.35 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.66 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000269969  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  29.97 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  29.44 
 
 		 376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.45 
 
 		 374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218776  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  29.52 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  29.52 
 
 		 376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.71 
 
 		 374 aa  173  5.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.31 
 
 		 378 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.95 
 
 		 372 aa  172  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  28.99 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>