More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_00001 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 		 397 aa  801    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  66.49 
 
 		 388 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  64.42 
 
 		 385 aa  528  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  63.9 
 
 		 385 aa  521  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  63.92 
 
 		 386 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  63.66 
 
 		 386 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  55.18 
 
 		 385 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  55.18 
 
 		 385 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  55.41 
 
 		 385 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  53.89 
 
 		 385 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  52.21 
 
 		 390 aa  389  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  47.18 
 
 		 382 aa  363  2e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  45.8 
 
 		 387 aa  346  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  45.04 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  45.04 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  44.84 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  42.27 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0075  DNA polymerase III beta subunit family protein  34.11 
 
 		 444 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.912734 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  32.04 
 
 		 376 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  31.27 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  31.78 
 
 		 378 aa  207  4e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  31.52 
 
 		 378 aa  205  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5506  DNA polymerase III, beta subunit  32.74 
 
 		 479 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399861 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.04 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  32.38 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.89 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.87 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.61 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.61 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  29.85 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  29.59 
 
 		 378 aa  182  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.43 
 
 		 375 aa  179  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  30.08 
 
 		 381 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.31 
 
 		 369 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  28.43 
 
 		 374 aa  176  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  28.13 
 
 		 377 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.08 
 
 		 372 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.05 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  32.09 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.31 
 
 		 372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  31.03 
 
 		 367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.05 
 
 		 372 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.05 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  28.91 
 
 		 366 aa  171  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.79 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.94 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.87 
 
 		 366 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.79 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.21 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.46 
 
 		 372 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  27.85 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.83 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.34 
 
 		 375 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  28.57 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  27.59 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.27 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  28.1 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.99 
 
 		 376 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.49 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.24 
 
 		 367 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.49 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.08 
 
 		 375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.13 
 
 		 370 aa  163  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.94 
 
 		 372 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  27.59 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  27.59 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  27.59 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  27.66 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.08 
 
 		 372 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  27.7 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.2 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  27.59 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.07 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  27.99 
 
 		 365 aa  160  5e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0008  DNA polymerase III, beta subunit  44.51 
 
 		 200 aa  160  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.89 
 
 		 398 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  30.23 
 
 		 377 aa  159  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  26.58 
 
 		 376 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  28.64 
 
 		 398 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.71 
 
 		 380 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.16 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  27.71 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.33 
 
 		 372 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.46 
 
 		 373 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0086  DNA polymerase III subunit beta  29.04 
 
 		 379 aa  157  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.2 
 
 		 381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.61 
 
 		 381 aa  156  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.93 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  28.93 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3047  DNA polymerase III subunit beta  28.42 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.579013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.54 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.54 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  29.44 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  27.54 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.3 
 
 		 397 aa  155  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  28.61 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  28.61 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.79 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  27.3 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.94 
 
 		 368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0963742  normal  0.484906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>