More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2552 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  93.37 
 
 		 377 aa  717    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 		 377 aa  760    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  93.37 
 
 		 377 aa  717    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  55.24 
 
 		 381 aa  426  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  55.24 
 
 		 381 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.44 
 
 		 378 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  54.21 
 
 		 379 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  54.09 
 
 		 379 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  54.19 
 
 		 381 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  54.21 
 
 		 379 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  54.21 
 
 		 379 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  54.21 
 
 		 379 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.56 
 
 		 379 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.4 
 
 		 381 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  53.56 
 
 		 379 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  51.59 
 
 		 378 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  45.41 
 
 		 380 aa  330  2e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  45.79 
 
 		 376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  42.78 
 
 		 378 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  40.21 
 
 		 378 aa  302  7.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  39.95 
 
 		 378 aa  298  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.26 
 
 		 380 aa  280  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  37.57 
 
 		 376 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.9 
 
 		 374 aa  270  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  37.57 
 
 		 376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  37.57 
 
 		 376 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  37.57 
 
 		 376 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  37.57 
 
 		 376 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  37.3 
 
 		 376 aa  269  8e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  36.77 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  36.77 
 
 		 376 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  36.24 
 
 		 376 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  35.71 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.83 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.11 
 
 		 367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.04 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.76 
 
 		 366 aa  242  6e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.76 
 
 		 366 aa  242  6e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.79 
 
 		 370 aa  242  9e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.07 
 
 		 365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.31 
 
 		 366 aa  233  5e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  34.22 
 
 		 366 aa  229  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.76 
 
 		 370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.81 
 
 		 367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  31.96 
 
 		 376 aa  216  7e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.6 
 
 		 366 aa  202  7e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  31.3 
 
 		 367 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.48 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.71 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.08 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.75 
 
 		 389 aa  193  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.66 
 
 		 372 aa  192  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  30.77 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.4 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  31.03 
 
 		 366 aa  190  4e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  31.58 
 
 		 370 aa  190  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.95 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.61 
 
 		 372 aa  186  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  29.79 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.56 
 
 		 375 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  29.43 
 
 		 378 aa  182  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.12 
 
 		 369 aa  182  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  29.69 
 
 		 378 aa  182  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.66 
 
 		 372 aa  182  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  29.24 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.77 
 
 		 387 aa  179  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  31.33 
 
 		 369 aa  179  5.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.06 
 
 		 373 aa  179  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.72 
 
 		 366 aa  179  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000466477  normal  0.315264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  28.87 
 
 		 372 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  28.57 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  29.12 
 
 		 377 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  30.3 
 
 		 374 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.8 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.96 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.08 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  28.57 
 
 		 378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.58 
 
 		 373 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  28.84 
 
 		 382 aa  173  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.91 
 
 		 375 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.65 
 
 		 388 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.91 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.79 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.32 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.1 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000485336  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0137  DNA polymerase III subunit beta  27.27 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000108126  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  28.01 
 
 		 373 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.13 
 
 		 397 aa  170  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  28.8 
 
 		 373 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.32 
 
 		 372 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.65 
 
 		 375 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.87 
 
 		 372 aa  169  9e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  28.61 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00003  DNA polymerase III, beta subunit  29.26 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000112219  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.97 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.06 
 
 		 373 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.47 
 
 		 365 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1429  DNA polymerase III subunit beta  28.91 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00443  DNA polymerase III subunit beta  28.88 
 
 		 366 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  28.53 
 
 		 373 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>