More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_2699 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  85.9 
 
 
376 aa  664    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  94.15 
 
 
376 aa  722    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  98.14 
 
 
376 aa  745    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  96.01 
 
 
376 aa  733    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  97.61 
 
 
376 aa  741    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  98.14 
 
 
376 aa  745    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  96.81 
 
 
376 aa  738    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  85.9 
 
 
376 aa  663    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 
376 aa  758    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  82.18 
 
 
376 aa  629  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  41.88 
 
 
381 aa  309  5e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  41.1 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  41.1 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  40.79 
 
 
379 aa  305  6e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.79 
 
 
379 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.79 
 
 
379 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  40.79 
 
 
379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.79 
 
 
379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.31 
 
 
381 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.26 
 
 
379 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  40.26 
 
 
379 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  39.05 
 
 
378 aa  288  9e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.52 
 
 
378 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.83 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.83 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  37.57 
 
 
377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.34 
 
 
378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.13 
 
 
380 aa  239  5.999999999999999e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.24 
 
 
374 aa  227  3e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.51 
 
 
366 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.51 
 
 
366 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.77 
 
 
370 aa  212  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  33.86 
 
 
378 aa  211  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  32.02 
 
 
376 aa  208  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.04 
 
 
365 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.82 
 
 
374 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.51 
 
 
378 aa  204  2e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.11 
 
 
380 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.45 
 
 
370 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.59 
 
 
367 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.16 
 
 
367 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  29.26 
 
 
366 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.21 
 
 
365 aa  179  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0484  DNA polymerase III, beta subunit  26.39 
 
 
370 aa  176  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000936816  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.44 
 
 
366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  27.44 
 
 
366 aa  171  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.99 
 
 
385 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.99 
 
 
385 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.66 
 
 
367 aa  169  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.97 
 
 
366 aa  169  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  28.53 
 
 
376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.99 
 
 
385 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  29.61 
 
 
377 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.11 
 
 
370 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1087  DNA polymerase III, beta subunit  26.98 
 
 
369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000722327  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  25.85 
 
 
390 aa  162  7e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  25.69 
 
 
393 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.58 
 
 
385 aa  162  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.7 
 
 
374 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  25.69 
 
 
393 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.74 
 
 
385 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.21 
 
 
385 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  28.5 
 
 
377 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.59 
 
 
397 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  25.84 
 
 
374 aa  160  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.94 
 
 
372 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.65 
 
 
365 aa  158  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.12 
 
 
396 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  28.72 
 
 
378 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  27.86 
 
 
394 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0002  DNA-directed DNA polymerase  28.94 
 
 
409 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  26.85 
 
 
378 aa  153  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.34 
 
 
389 aa  152  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  26.34 
 
 
378 aa  151  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.97 
 
 
376 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  25.06 
 
 
378 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  26.28 
 
 
382 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.01 
 
 
375 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.01 
 
 
375 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  24.56 
 
 
388 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.2 
 
 
369 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.52 
 
 
387 aa  149  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.47 
 
 
375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.88 
 
 
375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  23.18 
 
 
374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.84 
 
 
367 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0815  DNA polymerase III, beta subunit  28.35 
 
 
375 aa  146  5e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000015774  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  27.76 
 
 
369 aa  146  6e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  28.31 
 
 
371 aa  146  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  26.11 
 
 
372 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.08 
 
 
373 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  25.33 
 
 
372 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  28.83 
 
 
370 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0162  DNA polymerase III subunit beta  27.42 
 
 
372 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281652  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03482  DNA polymerase III subunit beta  24.87 
 
 
366 aa  144  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  27.79 
 
 
373 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.07 
 
 
372 aa  143  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.81 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.07 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  27.08 
 
 
373 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>