More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1087 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1087  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 
369 aa  744    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000722327  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0484  DNA polymerase III, beta subunit  68.65 
 
 
370 aa  520  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000936816  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.11 
 
 
374 aa  192  8e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  27.25 
 
 
376 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  27.18 
 
 
376 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  28.31 
 
 
376 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  28.04 
 
 
376 aa  179  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  27.78 
 
 
376 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  27.25 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  27.25 
 
 
376 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  27.25 
 
 
376 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  27.25 
 
 
376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.61 
 
 
378 aa  169  9e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.56 
 
 
390 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.46 
 
 
387 aa  166  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  30.59 
 
 
393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  30.59 
 
 
393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  28.22 
 
 
382 aa  165  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  28.68 
 
 
394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.22 
 
 
370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.38 
 
 
379 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  28.38 
 
 
379 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  28.53 
 
 
379 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  28.53 
 
 
379 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.53 
 
 
379 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.35 
 
 
366 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.35 
 
 
366 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.53 
 
 
379 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.53 
 
 
379 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.12 
 
 
381 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.98 
 
 
378 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  27.86 
 
 
381 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  27.86 
 
 
381 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.37 
 
 
378 aa  159  7e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  26.3 
 
 
377 aa  158  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  25.53 
 
 
376 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  26.15 
 
 
367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  28.65 
 
 
374 aa  155  9e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.79 
 
 
381 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.12 
 
 
370 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.75 
 
 
377 aa  153  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.75 
 
 
377 aa  153  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.96 
 
 
367 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  25.72 
 
 
378 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.53 
 
 
375 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.07 
 
 
380 aa  144  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  27.5 
 
 
374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  25 
 
 
378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  24.15 
 
 
366 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  25.26 
 
 
378 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  25.78 
 
 
397 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.55 
 
 
372 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  28.46 
 
 
378 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  25.76 
 
 
376 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  25.27 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.33 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.35 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.75 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  22.85 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.5 
 
 
389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  25.27 
 
 
378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  26.32 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1549  DNA polymerase III, beta subunit  24.1 
 
 
374 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15445  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  25.26 
 
 
376 aa  133  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  22.85 
 
 
385 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.12 
 
 
367 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.52 
 
 
372 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0075  DNA polymerase III beta subunit family protein  28.49 
 
 
444 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.912734 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.79 
 
 
375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  22.73 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.27 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  26.03 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.82 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.25 
 
 
369 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.48 
 
 
375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  25.13 
 
 
377 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0347  DNA polymerase III subunit beta  23.08 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0616  DNA polymerase III, beta subunit  24.93 
 
 
372 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  27.69 
 
 
372 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.76 
 
 
372 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25 
 
 
365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.8 
 
 
366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4592  DNA polymerase III subunit beta  27.3 
 
 
372 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0352599 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.12 
 
 
376 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.9 
 
 
372 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.03 
 
 
376 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000849521  normal  0.168185 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3005  DNA polymerase III, beta subunit  30.34 
 
 
391 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0494623  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  27.57 
 
 
372 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.72 
 
 
372 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2720  DNA polymerase III, beta subunit  24.64 
 
 
372 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3235  DNA polymerase III, beta subunit  24 
 
 
374 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0867918 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.25 
 
 
366 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00540998  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.1 
 
 
388 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  26.61 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  25.75 
 
 
365 aa  120  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.74 
 
 
361 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000320383  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0815  DNA polymerase III, beta subunit  24.46 
 
 
375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000015774  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  27.47 
 
 
373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  26.87 
 
 
373 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>