More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A2706 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  84.57 
 
 
376 aa  656    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  85.37 
 
 
376 aa  658    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  86.44 
 
 
376 aa  666    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  84.04 
 
 
376 aa  640    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  85.11 
 
 
376 aa  654    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  85.37 
 
 
376 aa  658    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  97.61 
 
 
376 aa  735    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 
376 aa  751    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  85.9 
 
 
376 aa  664    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  86.44 
 
 
376 aa  669    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  39.53 
 
 
381 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.31 
 
 
381 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  39.53 
 
 
381 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  39.79 
 
 
381 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  39.21 
 
 
379 aa  296  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  39.21 
 
 
379 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  39.21 
 
 
379 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  39.21 
 
 
379 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  39.21 
 
 
379 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.95 
 
 
379 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  38.95 
 
 
379 aa  289  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  39.84 
 
 
378 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.52 
 
 
378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  36.24 
 
 
377 aa  260  3e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.68 
 
 
377 aa  259  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.68 
 
 
377 aa  259  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.98 
 
 
380 aa  238  1e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.77 
 
 
378 aa  226  4e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.15 
 
 
374 aa  221  9.999999999999999e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  33.07 
 
 
376 aa  216  5e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.54 
 
 
365 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.98 
 
 
370 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.55 
 
 
374 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.71 
 
 
366 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.71 
 
 
366 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.94 
 
 
380 aa  207  3e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  32.21 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.23 
 
 
370 aa  199  7e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.98 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.62 
 
 
367 aa  193  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  30.05 
 
 
366 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.44 
 
 
367 aa  182  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.08 
 
 
370 aa  179  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  31.3 
 
 
365 aa  179  8e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.02 
 
 
366 aa  176  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.32 
 
 
366 aa  176  8e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.97 
 
 
385 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  28.23 
 
 
366 aa  170  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.97 
 
 
385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.97 
 
 
385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.13 
 
 
367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  26.93 
 
 
393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  26.93 
 
 
393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.45 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0484  DNA polymerase III, beta subunit  24.8 
 
 
370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000936816  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.72 
 
 
385 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.66 
 
 
397 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.18 
 
 
390 aa  161  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.44 
 
 
374 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.72 
 
 
385 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.13 
 
 
388 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  28.68 
 
 
377 aa  159  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.66 
 
 
387 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.51 
 
 
375 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1087  DNA polymerase III, beta subunit  26.19 
 
 
369 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000722327  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.91 
 
 
365 aa  155  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  28.17 
 
 
377 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  27.15 
 
 
376 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  27.81 
 
 
378 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  29.6 
 
 
394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  25.32 
 
 
378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  27.3 
 
 
378 aa  152  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  26.81 
 
 
382 aa  152  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.94 
 
 
372 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  27.39 
 
 
378 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  28.57 
 
 
371 aa  149  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.25 
 
 
369 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.27 
 
 
375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.21 
 
 
389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.53 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.27 
 
 
375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  25.87 
 
 
396 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  27.89 
 
 
367 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.01 
 
 
375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0002  DNA-directed DNA polymerase  28.28 
 
 
409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  25.84 
 
 
374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.97 
 
 
376 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.13 
 
 
369 aa  145  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.11 
 
 
372 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0162  DNA polymerase III subunit beta  28.46 
 
 
372 aa  143  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281652  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  25.07 
 
 
372 aa  142  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03482  DNA polymerase III subunit beta  24.6 
 
 
366 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  25.33 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1278  DNA polymerase III subunit beta  27.72 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  2.76035e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  24.8 
 
 
372 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  26.04 
 
 
373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  25 
 
 
372 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  25 
 
 
372 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.27 
 
 
375 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.140323  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.8 
 
 
372 aa  139  7.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>