More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0002 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0002  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 375 aa  723    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.140323  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl002  DNA polymerase III, beta chain  44.62 
 
 		 373 aa  331  1e-89  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.6 
 
 		 378 aa  156  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.13 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  29.37 
 
 		 379 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.37 
 
 		 379 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.37 
 
 		 379 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.1 
 
 		 381 aa  154  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.1 
 
 		 379 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  29.1 
 
 		 379 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.67 
 
 		 377 aa  153  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.67 
 
 		 377 aa  153  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.1 
 
 		 379 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.78 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  29.1 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  27.51 
 
 		 381 aa  149  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  27.51 
 
 		 381 aa  149  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  25.13 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  27.55 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  27.7 
 
 		 376 aa  143  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  27.15 
 
 		 376 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  27.15 
 
 		 376 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  27.15 
 
 		 376 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  27.42 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  27.55 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  27.27 
 
 		 376 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  26.32 
 
 		 376 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  26.4 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.88 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.06 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.26 
 
 		 378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  23.73 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.8 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.34 
 
 		 380 aa  126  6e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.03 
 
 		 370 aa  126  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  25.4 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.73 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  25.47 
 
 		 366 aa  119  9e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.54 
 
 		 369 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  24.4 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.73 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.73 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.87 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.81 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.03 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490932  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.73 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.82 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0002  DNA-directed DNA polymerase  24 
 
 		 367 aa  110  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.32 
 
 		 385 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.42 
 
 		 366 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000136085  unclonable  0.00000000917615 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  25.15 
 
 		 374 aa  109  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.35 
 
 		 385 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.16 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000158001  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0086  DNA polymerase III subunit beta  25.2 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.77 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.77 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.77 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000143129 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.77 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637071  unclonable  0.00000000000326658 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0091  DNA polymerase III, beta subunit  24.54 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.731549  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  25.88 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0051  DNA polymerase III, beta subunit  24.54 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213452 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0074  DNA polymerase III, beta subunit  24.54 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000073045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  25.92 
 
 		 385 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0002  DNA polymerase III subunit beta  21.22 
 
 		 367 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.121469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.27 
 
 		 385 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0011  DNA polymerase III subunit beta  21.87 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12322  hitchhiker  0.00002839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0002  DNA polymerase III subunit beta  21.87 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123405  normal  0.0743731 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0137  DNA polymerase III subunit beta  21.87 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000108126  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0014  DNA-directed DNA polymerase  23.71 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000733559  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.16 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000200886  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  25.51 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.2 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000485336  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.71 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000577304  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.71 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000472427  hitchhiker  0.00139326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0010  DNA polymerase III, beta subunit  23.71 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000642144  hitchhiker  0.00000000134313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  23.58 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  23.4 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.47 
 
 		 367 aa  103  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  23.39 
 
 		 372 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0009  DNA polymerase III, beta subunit  23.26 
 
 		 366 aa  102  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0007  DNA-directed DNA polymerase  23.97 
 
 		 366 aa  102  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000118658  unclonable  0.000000000121971 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.96 
 
 		 366 aa  102  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000544098  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0004  DNA polymerase III subunit beta  21.6 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.34 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.02 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000905958  normal  0.127223 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.32 
 
 		 372 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.02 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000466477  normal  0.315264 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.22 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2506  DNA polymerase III subunit beta  22.02 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000126636  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0002  DNA polymerase III, beta subunit  21.77 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.74 
 
 		 372 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  22.51 
 
 		 367 aa  100  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  24.54 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.46 
 
 		 398 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0186  DNA polymerase III, beta subunit  23.38 
 
 		 379 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00020  DNA polymerase III subunit beta  21.3 
 
 		 367 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  21.97 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0002  DNA polymerase III subunit beta  21.3 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  21.22 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.61 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000267756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>