More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0002 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 374 aa  757    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  42.44 
 
 		 379 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  42.44 
 
 		 379 aa  293  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  42.44 
 
 		 379 aa  293  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  42.44 
 
 		 379 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  42.44 
 
 		 379 aa  293  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  42.44 
 
 		 379 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  42.44 
 
 		 379 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  41.69 
 
 		 381 aa  293  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  41.69 
 
 		 381 aa  293  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  41.16 
 
 		 381 aa  290  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  41.99 
 
 		 381 aa  290  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  40 
 
 		 378 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  37 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  37 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.53 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  36.9 
 
 		 377 aa  270  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.54 
 
 		 380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  34.13 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.22 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.98 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.89 
 
 		 367 aa  216  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  31.55 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.91 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  31.28 
 
 		 376 aa  209  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  32.35 
 
 		 376 aa  209  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  31.55 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  31.82 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  32.09 
 
 		 378 aa  206  6e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  32.09 
 
 		 376 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  31.82 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  31.55 
 
 		 376 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.89 
 
 		 378 aa  199  6e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  31.28 
 
 		 376 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  31.28 
 
 		 376 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.27 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  32.57 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.65 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.65 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.28 
 
 		 366 aa  192  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.56 
 
 		 374 aa  190  4e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  31.93 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  31.09 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.44 
 
 		 370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3235  DNA polymerase III, beta subunit  29.21 
 
 		 374 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0867918 
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  30.57 
 
 		 378 aa  182  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  30.9 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  30.9 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.48 
 
 		 367 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  31.23 
 
 		 374 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00003  DNA polymerase III, beta subunit  30.29 
 
 		 366 aa  179  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000112219  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.19 
 
 		 365 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  29.78 
 
 		 374 aa  179  9e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  30.05 
 
 		 378 aa  179  9e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.76 
 
 		 366 aa  177  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1087  DNA polymerase III, beta subunit  31.13 
 
 		 369 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000722327  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  32.29 
 
 		 390 aa  176  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0484  DNA polymerase III, beta subunit  31.66 
 
 		 370 aa  176  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000936816  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.46 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  30.42 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  30.91 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  27.54 
 
 		 367 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  30.51 
 
 		 382 aa  172  7.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.22 
 
 		 367 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000485336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.63 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1549  DNA polymerase III, beta subunit  27.03 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  30.23 
 
 		 377 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.2 
 
 		 385 aa  170  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.81 
 
 		 374 aa  169  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.24 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.79 
 
 		 397 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.38 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.89 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.63 
 
 		 372 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.9 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.25 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.26 
 
 		 385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  30.57 
 
 		 378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  29.55 
 
 		 372 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00443  DNA polymerase III subunit beta  28.84 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2720  DNA polymerase III, beta subunit  27.37 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.98 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4122  DNA polymerase III subunit beta  29.57 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4171  DNA polymerase III subunit beta  29.57 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.264257  normal  0.345578 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  29.19 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0010  DNA polymerase III subunit beta  29.07 
 
 		 369 aa  160  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000914164  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.43 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4229  DNA polymerase III subunit beta  29.3 
 
 		 366 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4065  DNA polymerase III subunit beta  29.3 
 
 		 366 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00365243  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.92 
 
 		 373 aa  159  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002008  DNA polymerase III beta subunit  28.03 
 
 		 366 aa  159  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000997729  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0137  DNA polymerase III subunit beta  27.96 
 
 		 366 aa  159  9e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000108126  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4049  DNA polymerase III subunit beta  29.3 
 
 		 366 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  29.79 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.03 
 
 		 366 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0616  DNA polymerase III, beta subunit  26.11 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4176  DNA polymerase III subunit beta  29.57 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000208549  normal  0.014688 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4152  DNA polymerase III subunit beta  29.57 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517824  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.57 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.020055  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00020  DNA polymerase III subunit beta  29.6 
 
 		 367 aa  156  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>