More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0002 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  100 
 
 		 376 aa  751    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  52.37 
 
 		 380 aa  389  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  48.43 
 
 		 378 aa  332  6e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  45.79 
 
 		 377 aa  326  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  45.14 
 
 		 379 aa  324  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  44.74 
 
 		 377 aa  325  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  44.74 
 
 		 377 aa  325  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  44.91 
 
 		 381 aa  323  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  44.91 
 
 		 381 aa  323  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  44.65 
 
 		 381 aa  322  5e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  44.88 
 
 		 379 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  44.88 
 
 		 379 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  44.88 
 
 		 379 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  46.05 
 
 		 378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  44.88 
 
 		 379 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  44.65 
 
 		 381 aa  319  6e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  44.62 
 
 		 379 aa  318  7e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  44.62 
 
 		 379 aa  318  7e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  45.79 
 
 		 378 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  42.48 
 
 		 378 aa  292  6e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  42.74 
 
 		 378 aa  289  6e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  42.89 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  39.63 
 
 		 380 aa  265  8.999999999999999e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.13 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.67 
 
 		 365 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.39 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  33.33 
 
 		 376 aa  220  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  32.81 
 
 		 376 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  33.07 
 
 		 376 aa  216  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  33.07 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  33.33 
 
 		 376 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  32.55 
 
 		 376 aa  210  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  32.02 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  32.02 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  31.76 
 
 		 376 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  31.76 
 
 		 376 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  33.42 
 
 		 366 aa  203  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.98 
 
 		 370 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.44 
 
 		 367 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.48 
 
 		 366 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.48 
 
 		 366 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.71 
 
 		 367 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.59 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.3 
 
 		 375 aa  189  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.73 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30 
 
 		 369 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  28.72 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.41 
 
 		 370 aa  182  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.6 
 
 		 374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.87 
 
 		 366 aa  178  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.85 
 
 		 389 aa  176  9e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  26.82 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3032  DNA polymerase III, beta subunit  29.71 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  32.09 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.84 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  28.57 
 
 		 376 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.65 
 
 		 373 aa  172  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.63 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  29.5 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  28.08 
 
 		 372 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.53 
 
 		 398 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  28.87 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.95 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.86 
 
 		 376 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.56 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.27 
 
 		 366 aa  162  6e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  27.27 
 
 		 398 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  31.12 
 
 		 385 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.67 
 
 		 386 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  28.53 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  31.33 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.56 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.18 
 
 		 379 aa  160  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  29.47 
 
 		 386 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.56 
 
 		 385 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  29.4 
 
 		 367 aa  159  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  28.8 
 
 		 373 aa  159  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.06 
 
 		 390 aa  158  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  28.08 
 
 		 378 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.55 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186277  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.67 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  28.08 
 
 		 378 aa  157  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.86 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.56 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  28.76 
 
 		 374 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.37 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  27.94 
 
 		 377 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00020  DNA polymerase III subunit beta  30.56 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00003  DNA polymerase III, beta subunit  28.86 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000112219  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  28.27 
 
 		 378 aa  157  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.08 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  28.35 
 
 		 372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.53 
 
 		 365 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.03 
 
 		 372 aa  156  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.08 
 
 		 398 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  26.08 
 
 		 398 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0137  DNA polymerase III subunit beta  28.65 
 
 		 366 aa  155  9e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000108126  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.8 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348811  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  29.88 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4049  DNA polymerase III subunit beta  29.26 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>