More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0002 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 
378 aa  758    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  83.86 
 
 
378 aa  654    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  74.02 
 
 
381 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  74.02 
 
 
381 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  74.41 
 
 
379 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  74.41 
 
 
379 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  74.41 
 
 
379 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  74.02 
 
 
381 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  73.23 
 
 
381 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  74.41 
 
 
379 aa  571  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  74.41 
 
 
379 aa  571  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  74.14 
 
 
379 aa  566  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  74.14 
 
 
379 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  53.44 
 
 
377 aa  422  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  52.89 
 
 
377 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  52.89 
 
 
377 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  47.51 
 
 
380 aa  347  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  46.05 
 
 
376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  42.93 
 
 
378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  40.37 
 
 
376 aa  294  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  39.58 
 
 
376 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  39.31 
 
 
376 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  39.84 
 
 
376 aa  290  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  39.05 
 
 
376 aa  288  9e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  39.31 
 
 
376 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  39.05 
 
 
376 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  39.05 
 
 
376 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  39.05 
 
 
376 aa  285  9e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  38.79 
 
 
376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  40 
 
 
374 aa  278  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  39.05 
 
 
378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.32 
 
 
380 aa  271  1e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  38.2 
 
 
365 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.37 
 
 
374 aa  261  1e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  36.94 
 
 
378 aa  257  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.54 
 
 
367 aa  257  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.89 
 
 
370 aa  255  9e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.48 
 
 
370 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.77 
 
 
366 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.77 
 
 
366 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.04 
 
 
366 aa  246  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  35.64 
 
 
366 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.71 
 
 
367 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.3 
 
 
370 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  31.75 
 
 
366 aa  207  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  31.41 
 
 
374 aa  206  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  29.77 
 
 
376 aa  203  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.94 
 
 
372 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.42 
 
 
389 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.07 
 
 
373 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  29.79 
 
 
374 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  30.37 
 
 
372 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  30.91 
 
 
378 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  32.81 
 
 
372 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  32.81 
 
 
372 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.52 
 
 
366 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  30.65 
 
 
378 aa  186  5e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  32.37 
 
 
367 aa  186  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  29.95 
 
 
378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.08 
 
 
365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  31.59 
 
 
372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  31.23 
 
 
370 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.55 
 
 
373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0003  DNA polymerase III subunit beta  32.03 
 
 
372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  hitchhiker  0.00000350231 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.37 
 
 
367 aa  182  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  28.91 
 
 
377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  29.06 
 
 
372 aa  180  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.67 
 
 
375 aa  179  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.75 
 
 
372 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  31.67 
 
 
393 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  31.67 
 
 
393 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.57 
 
 
365 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.77 
 
 
373 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  28.39 
 
 
377 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  29.18 
 
 
366 aa  177  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  30.67 
 
 
373 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.49 
 
 
372 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  29.58 
 
 
412 aa  176  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  29.58 
 
 
372 aa  176  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.41 
 
 
373 aa  176  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0002  DNA-directed DNA polymerase  29.09 
 
 
409 aa  176  8e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  29.95 
 
 
373 aa  175  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.51 
 
 
369 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.61 
 
 
373 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.99 
 
 
373 aa  175  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0966551  normal  0.572668 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.58 
 
 
369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.91 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000466477  normal  0.315264 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  30.29 
 
 
372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2834  DNA polymerase III subunit beta  30.03 
 
 
372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.95 
 
 
366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637071  unclonable  0.00000000000326658 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.95 
 
 
366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.95 
 
 
366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000143129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.95 
 
 
366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.49 
 
 
372 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.72 
 
 
372 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0484  DNA polymerase III, beta subunit  30.37 
 
 
370 aa  173  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000936816  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.43 
 
 
373 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  30.41 
 
 
373 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.43 
 
 
374 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.24 
 
 
372 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>